Articles 【タンパク質デザイン】分子最適化にも応用できるタンパク質バインダーデザイン手法EvoProとは
AF2とProteinMPNNの反復実行でタンパク質性のバインダーを生成するパイプラインEvoProについて紹介します。
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Articles Articles 【タンパク質デザイン】強化学習でタンパク質をトップダウン的にデザインする Science 論文
強化学習を用いて、タンパク質を、その全体構造を規定してトップダウン的に設計する手法を紹介します。
Articles 【タンパク質デザイン】拡散モデルで望みの2次構造をもつタンパク質をデザインする方法
拡散モデルを利用して、望みの2次構造の構成を示すタンパク質を生成する手法について紹介します。
Articles 【バインダーデザイン】深層学習以前のバインダーデザイン手法をレビュー
バインダーに特化したタンパク質の計算化学的デザイン手法をレビューした論文を紹介します。
Articles 【バインダーデザイン】往年の結合タンパク質デザイン手法DDMIの活用例
インシリコバインダーデザインプロトコル、DDMIについての報告です。
Articles 【タンパク質デザイン】フレキシブルモチーフグラフティングの基礎
モチーフグラフティングの手法として、flexible backbone grafting を紹介します。
Articles 【タンパク質デザイン】従来の不連続エピトープグラフティング手法「マルチグラフトデザイン」とは
HIV gp120の不連続なエピトープを対象に、モチーフグラフティングを実施した事例を紹介します。
Articles 【バインダーデザイン】β-シート間相互作用で結合界面をデザイン
β-シート間相互作用で２量化するタンパク質を人工的にデザインした事例を紹介します。
Articles 【バインダーデザイン】計算機で天然より優れた結合ネットワークをデザイン！
DNase（ColE7）とその免疫阻害タンパク質（Im7）の相互作用界面を計算機で最適化し、野生型タンパク質より優れた特異性を付与したデザイン事例を紹介します。
Articles 【バインダーデザイン】結合特異性の高いタンパク質を、計算機でデザインするための方法論
既存の結合界面構造を出発点として、相同性の高いファミリー間で結合特異性のある分子を計算機でデザインした報告を紹介します。