Articles 【de novoデザイン】ProteinSolverでデザインしたタンパク質をAlphaFold2で構造予測
ProteinSolverを用いてデザインしたタンパク質の評価指標の1つとして、AlphaFold2による予測構造を利用したデザイン事例を紹介します。
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Articles Articles 【MDシミュレーション】創薬研究におけるMDシミュレーションの適応事例
タンパク質の分子動力学シミュレーションに関するレビュー論文を紹介します。
Articles 【量子コンピュータ】Rosettaの機能を量子コンピュータで実現 QPackerとは
量子アルゴリズムでRosetta Packerの手法を実現させた、QPackerについて紹介します。
Articles 【de novoデザイン】タンパク質の２次構造をパラメータで表現する
"protein universe"と呼ばれるタンパク質構造の空間の中で、未開拓な構造や機能を探索する方法についてレビューした論文を紹介します。
Articles 【タンパク質デザイン】ProteinSolverの使い方
ProteinSolverをウェブサーバで使用する際のプロトコルを紹介します。
Articles 【de novoデザイン】GNNを利用したタンパク質デザインモデルProteinSolverを解説
グラフニューラルネットワークを利用したタンパク質デザインモデル、ProteinSolverを紹介します。
Articles 【量子コンピュータ】GNNモデルを用いたタンパク質デザインを量子コンピュータで実現？
タンパク質の構造予測問題に対して、量子コンピュータによる解決に適した手法について、紹介します。
Articles 【レビュー】タンパク質のde novoデザインのプレイヤー・市場動向まとめ
タンパク質のインシリコ構造予測やデザインについて、解説したレビュー論文を紹介します。
Articles 【deep learning】元祖タンパク質事前学習モデルTAPEの紹介
タンパク質の事前学習言語モデルである、TAPE（Tasks Assessing Protein Embeddings）について紹介します。
Articles 【タンパク質デザイン】事前学習モデルとベイズ最適化の組み合わせで、タンパク質をエンジニアリング
ベイズ最適化によるタンパク質の分子デザイン手法を、事前学習モデルにも適用できる手法を紹介します。