Articles 【配列デザイン】CNNでタンパク質の主鎖構造から配列をデザイン
タンパク質の主鎖構造から、深層学習を利用して、配列をデザインする手法について紹介します。
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Articles Articles 【Rosetta】結合モチーフをグラフティングする手法、”MotifGraft mover”を解説
標的タンパク質に対して結合するバインダーペプチドを、スキャフォールドへグラフティングする"MotifGraft mover"について、解説します。
Articles 【Rosetta】テキストファイルひとつでデザインできる！RosettaRemodelというインターフェースについて
Rosettaに実装された、タンパク質をデザインするための統一インターフェースである、RosettaRemodelについて紹介します。
Articles 【拡散モデル】ついにpico molarオーダーのバインダーをデザイン！ RF diffusionのポテンシャル
拡散モデルを用いたタンパク質デザイン手法 RF diffusionを提案した論文を紹介します。
Articles タンパク質の「フォールド」から「配列」を生成
タンパク質の「フォールド」から「アミノ酸配列」を予測する手法、Fold2Seqを紹介します。
Articles 【抗体デザイン】免疫ライブラリを使って、結合抗体を分類・生成する深層学習モデル
抗体のスクリーニングデータを使って、抗原結合抗体を分類・生成するモデルを紹介します。
Articles 【タンパク質構造解析】タンパク質構造を「周期表」で表現
タンパク質の構造レパトアを、周期表としてまとめる方法について紹介します。
Articles 【de novoデザイン】ProteinSolverでデザインしたタンパク質をAlphaFold2で構造予測
ProteinSolverを用いてデザインしたタンパク質の評価指標の1つとして、AlphaFold2による予測構造を利用したデザイン事例を紹介します。
Articles 【MDシミュレーション】創薬研究におけるMDシミュレーションの適応事例
タンパク質の分子動力学シミュレーションに関するレビュー論文を紹介します。
Articles 【量子コンピュータ】Rosettaの機能を量子コンピュータで実現 QPackerとは
量子アルゴリズムでRosetta Packerの手法を実現させた、QPackerについて紹介します。