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【タンパク質デザイン】柔軟性の高い配列を生成できる ProteinMPNN の改良モデル、Flexpert を紹介!

タンパク質の柔軟性を予測し、柔軟性の高い配列を設計する手法 Flexpert を紹介します!
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【バインダーデザイン】peptide-MHC バインダーにはデノボスキャフォールドがおすすめ

peptide-MHC に対するバインダーをデノボで設計した実施例を紹介します!
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【抗体デザイン】計算機デザインパイプライン EvolveX で Vsig4 VHH バインダーを最適化

抗体の最適化パイプライン EvolveX を紹介します!
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【RFpeptide】RFDiffusion を利用した環状ペプチドデザインで single nM のバインダー取得に成功

RFDiffusion を用いた環状ペプチド設計で、実験的にバインダーを設計できることを証明した論文を紹介します!
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【ペプチドデザイン】環状ペプチドを RFDiffusion で設計する方法

RFDiffusion を利用した環状ペプチド設計手法を紹介します!
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【抗体抗原結合予測】AlphaSeq データを使用した抗原結合予測の事前学習モデル AlphaBind について

抗体の抗原結合活性を予測するモデル AlphaBind について紹介します!
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【デノボバインダーデザイン】pMHC に対するバインダーをデノボデザイン

ペプチド-MHC複合体に対するバインダーをデノボデザインした実施例を紹介します!
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【タンパク質デザイン】Baker 研から “induced fit” 型のスイッチタンパク質をデノボデザインした研究報告を紹介!

環境に応答して induced fit 型で活性を示すタンパク質をデノボデザインした事例を紹介します!
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【プログラミング】タンパク質構造データを処理するための新しい Python パッケージ Afpdb とは

タンパク質構造データを処理するためのコーディングライブラリである Afpdb を紹介します!
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【タンパク質デザイン】タンパク質エンジニアリング専用の機械学習ツールを多数実装したライブラリ ProteusAI を紹介!

タンパク質のデザインと評価に有用な機械学習ツールを実装したオープンソースのライブラリである ProteusAI を紹介します!