Articles 【抗体】機械学習を活用した、抗体の開発適性評価手法まとめ
機械学習を活用した抗体デザイン手法をまとめたレビュー論文を紹介します。
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Articles Articles 【de novoデザイン】「抗体」に「幻覚」を、FvHallucinatorの概要について
抗体配列をデザインする手法、FvHallucinatorを提案した論文を紹介します。
Articles 【深層学習】分子間相互作用の高精度予測手法MaSIFとは
深層学習を用いた分子間相互作用予測手法である、MaSIFを提案した論文を紹介します。
Articles 【de novo design】ついにバインダーデザインが深層学習でも可能に
タンパク質間相互作用モチーフをデザインための、イメージキャプションアルゴリズムを利用した深層学習手法iNNterfaceDesignを紹介します。
Articles 【de novoデザイン】人工ミニプロテインをde novoデザインして、ウイルス中和分子を作製
インフルエンザウイルスタンパク質(HA)とボツリヌス毒素タンパク質(BoNT)に対して結合する、低分子量のタンパク質のde novoデザインに成功したことを報告した論文を紹介します。
Articles 【de novoデザイン】世界初！βバレル構造の蛍光タンパク質をin silicoデザイン
低分子の結合に応答して蛍光を発するβバレルタンパク質を、de novoデザインした報告について紹介します。
Articles 【de novoデザイン】SARS-CoV-2スパイクタンパク質を中和する分子をin silicoでデザイン
in silicoでSARS-CoV-2スパイクタンパク質に対する結合分子をデザインした報告を紹介します。
Articles 【構造予測】RoseTTAFoldを抗体構造予測に適応すると・・・
タンパク質構造予測のための深層学習モデルRoseTTAFoldを、抗体の構造予測に適応したときの予測精度を、従来のホモロジーモデリング手法と比較評価した論文を紹介します。
Articles 【エピトープ予測】深層学習モデルScanNetで、タンパク質の結合部位を予測
深層学習モデルScanNetを利用して、タンパク質間相互作用の結合部位を予測する方法を紹介します。
Articles 【構造予測】VHH抗体のin silico構造予測手法まとめ
VHHの構造予測手法についての総説を紹介します。