Articles 【de novo design】「Image Outpainting」を応用したタンパク質のデザイン手法を紹介
「Image Outpainting」の手法を利用して、タンパク質をデザインした報告を紹介します。
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Articles Articles 【AlphaFold】複合体構造予測手法を利用して、複数のバインダーから高親和性の分子を同定
AlphaFoldを利用して、分子の競合的な結合の確認や、競合分子同士の親和性比較ができることを示した論文を紹介します。
Articles 【de novo design】またしてもタンパク質デザインのレビューを読み解く②
タンパク質のin silico構造予測・デザイン手法をまとめた総説を紹介します。この記事では、デザインを中心に解説します。
Articles 【de novo design】またしてもタンパク質デザインのレビューを読み解く①
タンパク質のin silico構造予測・デザイン手法をまとめた総説を紹介します。この記事では、構造予測を中心に解説します。
Articles 【de novo design】結合分子をin silicoデザインする手法まとめ
標的タンパク質に結合するタンパク質をデザインする手法をまとめた総説を紹介します。
Articles 【de novo design】DeepDreamのパターン検出・生成技術を活用して、タンパク質にも「幻覚」を。
DeepDreamで適応された「hallucination」を活用して、タンパク質をde novoデザインした報告です。
Articles 【AlphaFold】De novo binder designも可能!? AlphaFold応用事例紹介
AlphaFoldを用いたタンパク質デザイン事例について紹介します。
Articles 【Rosetta】エネルギーランドスケープの重要性と、trRosettaの威力
trRosettaによるタンパク質デザイン手法が、大域的なエネルギーランドスケープに対して最適な構造を提案する能力があることを示した論文を紹介します。
Articles 【Rosetta】深層学習構造予測モデルtrRosettaの実態
タンパク質構造予測手法のひとつであるtrRosettaと、予測における残基間配向の重要性について紹介します。
Articles 【ドッキング】エピトープ情報を拘束条件に利用した抗VEGFR抗体の複合体予測
事前に同定された抗VEGFR2抗体の複合体構造を、実験データと計算手法を組み合わせて予測した実施例を紹介します。