Articles 【AbDesign】抗体のinsilicoデザイン手法の原理を解説
標的抗原に結合する抗体をデザインするアルゴリズム、AbDesignを紹介します。
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3D model 【今週の構造】それ以外のことは、全部二の次
3Dプリンターでタンパク質構造モデルを作成します。
Articles 【抗体デザイン】深層学習を活用したH3ループデザイン手法の原理
深層学習を活用して、抗体H3ループの構造をモデリングする技術であるDeepH3を紹介します。
Articles 【タンパク質構造解析】遺伝子組み換えとドメイン構造との関係を示す、『スキーマ』とは
タンパク質の3次構造として再構築可能な1種のフラグメントとして、スキーマ(SCHEMA)の概念を提案した論文を紹介します。
Articles 【タンパク質構造解析】表面露出残基をウェブサーバで解析 DeepRExとは
タンパク質の表面露出領域を予測する深層学習手法DeepRExについて紹介します。
3D model 【今週の構造】億万長者ビルゲイツの将来を見る目
有名人の名言から、タンパク質の構造をデザインします。今週はビルゲイツの名言です。
Articles 【タンパク質構造解析】深層学習を利用した、タンパク質の表面露出領域予測
深層学習を利用した、溶媒接触可能領域の推定法 EAGERERについて紹介します。
Articles 【抗体モデリング】H3ループの予測手法
標的抗原に結合する抗体の、HCDR3をデザインする手法について紹介します。
Articles 【Descriptor】3Dゼルニケ記述子を利用してタンパク質表面の特徴量を記述
抗体の抗原結合表面の形状と電荷プロファイルを、3Dゼルニケ記述子で表現することで、抗原結合性を予測することに成功した論文を紹介します。
Articles 【CASPでハイスコア】DLタンパク質構造予測手法のまとめ
深層学習を利用した各タンパク質構造予測手法の特徴を紹介します。