Articles 【グラフニューラルネットワーク】タンパク質構造をグラフ表現するためのPythonモジュールGrapheinについて
生物学的なデータを機械学習に供するためのグラフ表現を、柔軟かつ簡便におこなうためのPythonライブラリ、Grapheinを紹介した論文です。
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Articles Articles タンパク質の「フォールド」から「配列」を生成
タンパク質の「フォールド」から「アミノ酸配列」を予測する手法、Fold2Seqを紹介します。
Articles 【タンパク質構造解析】タンパク質構造を「周期表」で表現
タンパク質の構造レパトアを、周期表としてまとめる方法について紹介します。
Articles 【de novoデザイン】ProteinSolverでデザインしたタンパク質をAlphaFold2で構造予測
ProteinSolverを用いてデザインしたタンパク質の評価指標の1つとして、AlphaFold2による予測構造を利用したデザイン事例を紹介します。
Articles 【構造予測】あのAlphaFoldが、Google Colaboratoryで利用できる
AlphaFold2をGoogle Colaboratory環境で利用できる、ColabFoldについて紹介します。
Articles 【de novoデザイン】自己回帰モデルで、効率的に結合抗体を取得できるライブラリをデザイン
自然言語処理を適用した深層学習モデルを利用して、抗体ライブラリをデザインする手法を紹介します。
Articles 【de novoデザイン】抗体骨格構造を生成する深層学習モデルIg-VAEを紹介
抗体構造を計算機デザインする深層学習モデル、Ig-VAEを提案した論文を紹介します。
Articles 【de novoデザイン】TERMを利用したタンパク質の計算機デザイン手法dTERMenを解説
TERMを用いて、タンパク質の設計をおこなう手法dTERMenを紹介します。
Articles 【de novoデザイン】MaSIFを使ったバインダーデザイン手法を紹介
タンパク質間相互作用のデノボデザイン手法MaSIF-seedを提案した論文を紹介します。
Articles 【de novoデザイン】”inpainting”でタンパク質スキャフォールドをデザインする方法
機能モチーフをグラフティングするスキャフォールドをデザインするための深層学習手法を紹介します。