Articles 【総説】タンパク質複合体構造予測の現在地
タンパク質の複合体構造を予測する手法の課題について整理したレビュー論文を紹介します！
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Articles Articles 【最新】TCR-CD3の構造
TCR-CD3の、cryoEMでの8量体複合体構造の解析結果を紹介します。
Articles 【グラフニューラルネットワーク】タンパク質構造をグラフ表現するためのPythonモジュールGrapheinについて
生物学的なデータを機械学習に供するためのグラフ表現を、柔軟かつ簡便におこなうためのPythonライブラリ、Grapheinを紹介した論文です。
Articles タンパク質の「フォールド」から「配列」を生成
タンパク質の「フォールド」から「アミノ酸配列」を予測する手法、Fold2Seqを紹介します。
Articles 【タンパク質構造解析】タンパク質構造を「周期表」で表現
タンパク質の構造レパトアを、周期表としてまとめる方法について紹介します。
Articles 【de novoデザイン】ProteinSolverでデザインしたタンパク質をAlphaFold2で構造予測
ProteinSolverを用いてデザインしたタンパク質の評価指標の1つとして、AlphaFold2による予測構造を利用したデザイン事例を紹介します。
Articles 【構造予測】あのAlphaFoldが、Google Colaboratoryで利用できる
AlphaFold2をGoogle Colaboratory環境で利用できる、ColabFoldについて紹介します。
Articles 【de novoデザイン】自己回帰モデルで、効率的に結合抗体を取得できるライブラリをデザイン
自然言語処理を適用した深層学習モデルを利用して、抗体ライブラリをデザインする手法を紹介します。
Articles 【de novoデザイン】抗体骨格構造を生成する深層学習モデルIg-VAEを紹介
抗体構造を計算機デザインする深層学習モデル、Ig-VAEを提案した論文を紹介します。
Articles 【de novoデザイン】TERMを利用したタンパク質の計算機デザイン手法dTERMenを解説
TERMを用いて、タンパク質の設計をおこなう手法dTERMenを紹介します。