Articles 【Rosetta】エネルギーランドスケープの重要性と、trRosettaの威力
trRosettaによるタンパク質デザイン手法が、大域的なエネルギーランドスケープに対して最適な構造を提案する能力があることを示した論文を紹介します。
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Articles Articles 【Rosetta】深層学習構造予測モデルtrRosettaの実態
タンパク質構造予測手法のひとつであるtrRosettaと、予測における残基間配向の重要性について紹介します。
Articles 【ドッキング】エピトープ情報を拘束条件に利用した抗VEGFR抗体の複合体予測
事前に同定された抗VEGFR2抗体の複合体構造を、実験データと計算手法を組み合わせて予測した実施例を紹介します。
Articles 【ドッキング】実験情報を活用したタンパク質ドッキングシミュレーション手法（原著編）
事前に取得したエピトープ情報をもとに、抗体・抗原複合体構造のドッキングモデルを作成する手法について紹介します。
Foldit 【Foldit】HIV-TATペプチド
HIV-TATペプチドをFolditでモデリングしてみました。
Articles 【Rosetta】PyRosettaとJupyter Notebookを活用したRosetta学習ツールの紹介
PyRosettaとJupyter Notebookを活用して、Rosettaの利用方法を学べるツールを紹介します。
3D model 【Foldit】これまで作ったペプチドをFolditで操作してみた
Folditでタンパク質をデザインしてみました。
3D model 【今週の構造】何かに興味を持っていれば。
名言をタンパク質で表現する企画。今回は、エレノア・ルーズベルトの名言です。
Articles 【抗体デザイン】抗体の de novo デザインツール OptMAVEn の最新バージョンを紹介
抗体デザインツール OptMAVEn-2.0の原著論文を紹介します。
3D model 【今週の構造】難しいからやろうとしないのではない
名言をタンパク質で表現する企画。今回は、ルシウス・アンナエウス・セネカの名言です。