Articles 【抗体デザイン】Q学習を利用したH3の抗体最適化手法を紹介
Q学習による深層強化学習を利用して、抗体のデザインを試みた論文を紹介します。
2022-10
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ProteinSolverを用いてデザインしたタンパク質の評価指標の1つとして、AlphaFold2による予測構造を利用したデザイン事例を紹介します。
Articles 【構造予測】2億個のタンパク質のドメインを自動で分類するツール
タンパク質構造のドメイン分類を効率的に行う手法、DPAM(Domain Parser for AlphaFold Models)について紹介します。
Articles 【抗体デザイン】OptMAVEn-2.0で、SARS-CoV-2抗体をデザイン
OptMAVEn-2.0を用いた抗体デザインの実施例として、SARS-CoV-2 RBDに対する結合抗体の取得事例を紹介します。
Articles 【MDシミュレーション】創薬研究におけるMDシミュレーションの適応事例
タンパク質の分子動力学シミュレーションに関するレビュー論文を紹介します。
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量子アルゴリズムでRosetta Packerの手法を実現させた、QPackerについて紹介します。
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量子コンピュータの原理・アルゴリズムなどについて広く概説したレビュー論文を紹介します。
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ベイズ最適化で高親和性抗体を計算機デザインする手法、AntBOについて紹介します。
Articles 【de novoデザイン】タンパク質の２次構造をパラメータで表現する
"protein universe"と呼ばれるタンパク質構造の空間の中で、未開拓な構造や機能を探索する方法についてレビューした論文を紹介します。
Articles 【タンパク質デザイン】ProteinSolverの使い方
ProteinSolverをウェブサーバで使用する際のプロトコルを紹介します。