Articles 【抗体デザイン】一般的なタンパク質言語モデルでも、抗体の親和性増強は可能なのです
タンパク質配列を学習した自然言語モデルを、抗体の分子進化に適用した論文を紹介します！
2023-05
Articles Articles 【抗体デザイン】Dock＆Optimizeで、ゼロからIL-17Aに結合する抗体をデザインする手法
Dock and Optimize アプローチを採用した抗体のデノボデザイン手法を紹介します。
Articles 【バインダーデザイン】深層学習以前のバインダーデザイン手法をレビュー
バインダーに特化したタンパク質の計算化学的デザイン手法をレビューした論文を紹介します。
Articles 【バインダーデザイン】往年の結合タンパク質デザイン手法DDMIの活用例
インシリコバインダーデザインプロトコル、DDMIについての報告です。
Articles 【タンパク質デザイン】フレキシブルモチーフグラフティングの基礎
モチーフグラフティングの手法として、flexible backbone grafting を紹介します。
Articles 【タンパク質デザイン】従来の不連続エピトープグラフティング手法「マルチグラフトデザイン」とは
HIV gp120の不連続なエピトープを対象に、モチーフグラフティングを実施した事例を紹介します。
Articles 【バインダーデザイン】β-シート間相互作用で結合界面をデザイン
β-シート間相互作用で２量化するタンパク質を人工的にデザインした事例を紹介します。
Articles 【バインダーデザイン】計算機で天然より優れた結合ネットワークをデザイン！
DNase（ColE7）とその免疫阻害タンパク質（Im7）の相互作用界面を計算機で最適化し、野生型タンパク質より優れた特異性を付与したデザイン事例を紹介します。
Articles 【バインダーデザイン】結合特異性の高いタンパク質を、計算機でデザインするための方法論
既存の結合界面構造を出発点として、相同性の高いファミリー間で結合特異性のある分子を計算機でデザインした報告を紹介します。
Articles 【バインダーデザイン】FFLを用いた結合モチーフのグラフティングで、バインダーを計算機デザイン
Bcl-2ホモログであるBHRF1に対するバインダーデザインを報告した論文を紹介します。