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【遺伝子工学】DNAアセンブル法と関連ソフトウェアまとめ

プラスミド構築に必要な、DNAアセンブル手法、試薬・キット、ソフトウェアについて説明しているレビュー論文を紹介します。
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【de novo design】タンパク質デザインを学習するための、学部生向け教材を紹介!

タンパク質デザインについて、リモートで学習できるカリキュラムを紹介します。
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【抗体デザイン】RNNによる抗体構造予測・デザインツールDeepAbを紹介

抗体構造を予測するための深層学習手法である、DeepAbを紹介します。
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【抗体デザイン】抗体デザインもトランスフォーマーベースの深層学習モデルで

抗体配列を生成する深層学習モデル ImmunoglobulinLanguageModel(IgLM)について紹介します。
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【de novoデザイン】トランスフォーマーベースの深層学習モデルでタンパク質デザイン

大規模なタンパク質の構造データベースからモデルを構築して、天然のタンパク質の特徴を持ちながら進化的に無関係な配列を生成する手法(ProtGPT2)を紹介します。
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【抗体】機械学習を活用した、抗体の開発適性評価手法まとめ

機械学習を活用した抗体デザイン手法をまとめたレビュー論文を紹介します。
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【de novoデザイン】「抗体」に「幻覚」を、FvHallucinatorの概要について

抗体配列をデザインする手法、FvHallucinatorを提案した論文を紹介します。
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【深層学習】分子間相互作用の高精度予測手法MaSIFとは

深層学習を用いた分子間相互作用予測手法である、MaSIFを提案した論文を紹介します。
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【de novo design】ついにバインダーデザインが深層学習でも可能に

タンパク質間相互作用モチーフをデザインための、イメージキャプションアルゴリズムを利用した深層学習手法iNNterfaceDesignを紹介します。
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【de novoデザイン】人工ミニプロテインをde novoデザインして、ウイルス中和分子を作製

インフルエンザウイルスタンパク質(HA)とボツリヌス毒素タンパク質(BoNT)に対して結合する、低分子量のタンパク質のde novoデザインに成功したことを報告した論文を紹介します。