Articles 【タンパク質デザイン】GPT と ESM モデルを同時に訓練した生成モデルで抗菌ペプチドをデザイン
抗菌ペプチドやデヒドロゲナーゼなどの機能を持つタンパク質を生成するモデルを、GPT モデルのファインチューニングで構築した研究成果を示した論文を紹介します！
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Articles 【大規模データ】ヒトタンパク質の変異体を網羅解析！
ヒトタンパク質の改変体に対する安定性を網羅的に調べたデータを取得し、その特徴を解析した論文を紹介します！
Articles 【レビュー論文】タンパク質エンジニアリングのための深層学習手法総まとめ
タンパク質デザインに関連した深層学習手法をまとめたレビュー論文を紹介します！
Articles 【バインダーデザイン】ファージディスプレイの Enrichement ratio と true binder との相関性について
Inverse folding model を用いた Insulin receptor バインダーデザインの実施例を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】Contrastive Preference Optimization (CPO) を活用した大規模言語モデルのファインチューニング手法を紹介
Contrastive Preference Optimization (CPO) を活用してタンパク質言語モデルをファインチューニングし、抗体デザインに適用した事例を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】柔軟性の高い配列を生成できる ProteinMPNN の改良モデル、Flexpert を紹介！
タンパク質の柔軟性を予測し、柔軟性の高い配列を設計する手法 Flexpert を紹介します！
Articles 【バインダーデザイン】peptide-MHC バインダーにはデノボスキャフォールドがおすすめ
peptide-MHC に対するバインダーをデノボで設計した実施例を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】抗原配列のみからデノボでVH/VL配列を生成するバインダーデザイン手法 MAGE を紹介
ウイルス抗原に対して LLM モデルで抗体をデノボ設計する手法 MAGE を紹介します！
Articles 【SURFACE-Bind】バインダーデザインに重要な標的エピトープをヒトタンパク質に対して網羅的に探索
ヒトタンパク質の相互作用界面を網羅的に探索してデータベース化した論文を紹介します！
Articles 【抗体スクリーニング】独メルクから sdAb 取得プラットフォームの紹介
VHH 取得に NGS データに基づく LSTM ベースの配列生成モデルを活用した実施例を紹介します！