Articles 【deep learning】元祖タンパク質事前学習モデルTAPEの紹介
タンパク質の事前学習言語モデルである、TAPE（Tasks Assessing Protein Embeddings）について紹介します。
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Articles Articles 【抗体デザイン】CDRへのグラフティングアプローチで結合抗体をデザインする手法
標的抗原に結合するペプチドモチーフを抗体のCDRにグラフティングすることで、結合抗体デザインした実施例を紹介します。
Articles 【タンパク質デザイン】事前学習モデルとベイズ最適化の組み合わせで、タンパク質をエンジニアリング
ベイズ最適化によるタンパク質の分子デザイン手法を、事前学習モデルにも適用できる手法を紹介します。
Articles 【PPI】タンパク質間相互作用を予測する深層学習モデルSSnetとは
タンパク質間相互作用を予測する深層学習モデル SSnetを紹介します。
Articles 【構造予測】あのAlphaFoldが、Google Colaboratoryで利用できる
AlphaFold2をGoogle Colaboratory環境で利用できる、ColabFoldについて紹介します。
Articles 【de novoデザイン】深層学習を利用したタンパク質デザイン手法総まとめ
深層学習を利用して、タンパク質デザインする手法について、レビューした論文を紹介します。
Articles 【de novoデザイン】自己回帰モデルで、効率的に結合抗体を取得できるライブラリをデザイン
自然言語処理を適用した深層学習モデルを利用して、抗体ライブラリをデザインする手法を紹介します。
Articles 【de novoデザイン】抗体骨格構造を生成する深層学習モデルIg-VAEを紹介
抗体構造を計算機デザインする深層学習モデル、Ig-VAEを提案した論文を紹介します。
Articles 【de novoデザイン】拡散モデルを利用したタンパク質デザイン手法を紹介
"Diffusion Probabilistic Models"をタンパク質デザインに応用した手法を提案した論文です。
Articles 【de novoデザイン】TERMを利用したタンパク質の計算機デザイン手法dTERMenを解説
TERMを用いて、タンパク質の設計をおこなう手法dTERMenを紹介します。