Articles 【構造予測】AlphaFold でも変異効果は予測できます
AlphaFold の変異効果予測を、effective strain を指標に捉えることができることを示した論文を紹介します！
Articles
Articles Articles 【タンパク質デザイン】”ダークマター”タンパク質の実体とデザイン手法について
低解像度の構造モチーフを文字列形式で表現した「Sketch」と、それを設計可能なフォールディングに修正するVAEモデル「Genesis」を活用することで、非天然のデノボ構造（＝ダークマタータンパク質）を設計する手法について紹介します！
Articles 【抗体モデル】最先端の構造予測モデル BALM について
Bio-inspired Antibody Language Model (BALM) と呼ばれる構造予測モデルを紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】ヘリックス・ループの反復骨格構造を利用して、バインダーをデザインする方法
本研究は、DARPins のようなヘリックス・ループの反復構造を骨格としたタンパク質 (RBL) を計算機でデザインした報告を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】合理的にシードを生成するヘリックスバレル構造のデザイン
ヘリックスバンドル構造から新たなヘリックスを接続することで、ヘリックスバレル構造を合理的にデザインする手法を紹介します！
Articles 【タンパク質モデリング】Rosetta では、モデル膜の種類に応じて膜タンパク質の構造を調整できます
Rosetta の膜構造のモデリングフレームワークの改良を報告した論文を紹介します！
Articles 【抗体構造予測】AF2 と言語モデルを融合！ H3-OPTの構造予測成績を紹介
抗体のH3構造予測の新手法 H3-OPT について報告した論文です。
Articles 【タンパク質デザイン】環状ペプチドのデザインも AfDesign で。
AfDesign を利用して、標的抗原に結合する環状ペプチドをデザインした論文を紹介します！
Articles 【クライオ電顕】AF2 を利用して電子密度マップからの構造予測精度を向上！
電子密度マップからの構造推定手法 DeepTracer にAF2予測情報を取り入れて、解析精度を向上を試みた研究を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】新しいタンパク質デザイン手法、 CPDiffusion とは
タンパク質に適用できる拡散生成モデル CPDiffusion について紹介します！