Articles 【抗体デザイン】GearBind で高親和性抗体の改変探索
インシリコで抗体の親和性を増強する改変を予測するモデル GearBind を紹介します！
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Articles Articles 【レビュー】機械学習とタンパク質工学。
タンパク質工学に機械学習を用いる価値について、レビューした総説を紹介します！
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Articles 【AF2】ドメイン-モチーフインターフェースは、AF2-multimer で予測できる？
AF2 を用いた結合界面構造の予測の妥当性や限界について紹介します！
Articles 【リン酸化サイト同定】深層学習モデルでリン酸化配列を同定する方法
タンパク質のリン酸化サイトを同定するための深層学習モデルについて紹介します！
Articles 【相互作用予測】リガンド結合予測に、タンパク質の構造情報は必要？
深層学習を用いた、タンパク質・低分子リガンド間の相互作用強度予測モデルが、どのような特徴量を捉えて予測しているのか、検証した論文を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】AbDiffuser：拡散モデルでHER2抗体の配列を再設計
APMixer というアーキテクチャを利用した抗体のリデザイン手法について紹介します！
Articles 【AlphaFold】抗体・抗原複合体予測の最新ベンチマーク
AlphaFold による抗体・抗原複合体モデルの予測精度について検証した論文を紹介します！
Articles 【AlphaFold】AlphaFold-multimer の予測精度を高める AFProfile の威力
AlphaFold の複合体構造を予測するモードである AlphaFold-multimer の予測精度を高めるための方法について紹介します！
Articles 【抗体デザイン】既存の学習モデルを再活用、モデルリプログラミングとは
モデルリプログラミング (MR) という手法を使って抗体の CDR デザインを試みた文献を紹介します！