Articles 【タンパク質構造解析】トポロジー情報で、タンパク質をエンベディング
タンパク質の特徴を、トポロジカルな構造情報から説明したレポートを紹介します！
AlphaFold
Articles Articles 【AlphaFold】条件付き構造予測で、タンパク質の多状態構造をモデリング
AlphaFold によるタンパク質構造予測を、条件付きで実行する手法 AFEX について紹介します！
Articles 【構造予測】AlphaFold でも変異効果は予測できます
AlphaFold の変異効果予測を、effective strain を指標に捉えることができることを示した論文を紹介します！
Articles 【抗体構造予測】AF2 と言語モデルを融合！ H3-OPTの構造予測成績を紹介
抗体のH3構造予測の新手法 H3-OPT について報告した論文です。
Articles 【クライオ電顕】AF2 を利用して電子密度マップからの構造予測精度を向上！
電子密度マップからの構造推定手法 DeepTracer にAF2予測情報を取り入れて、解析精度を向上を試みた研究を紹介します！
Articles 【AF2】ドメイン-モチーフインターフェースは、AF2-multimer で予測できる？
AF2 を用いた結合界面構造の予測の妥当性や限界について紹介します！
Articles 【相互作用予測】リガンド結合予測に、タンパク質の構造情報は必要？
深層学習を用いた、タンパク質・低分子リガンド間の相互作用強度予測モデルが、どのような特徴量を捉えて予測しているのか、検証した論文を紹介します！
Articles 【AlphaFold】抗体・抗原複合体予測の最新ベンチマーク
AlphaFold による抗体・抗原複合体モデルの予測精度について検証した論文を紹介します！
Articles 【AlphaFold】AlphaFold-multimer の予測精度を高める AFProfile の威力
AlphaFold の複合体構造を予測するモードである AlphaFold-multimer の予測精度を高めるための方法について紹介します！
3D model 【タンパク質構造予測】AF2全盛期における複合体予測手法の将来展望は
AF2前後のタンパク質複合体構造予測手法をまとめたレビュー論文を紹介します！