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【抗体構造予測】AF2 と言語モデルを融合! H3-OPTの構造予測成績を紹介

抗体のH3構造予測の新手法 H3-OPT について報告した論文です。
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【抗体デザイン】GearBind で高親和性抗体の改変探索

インシリコで抗体の親和性を増強する改変を予測するモデル GearBind を紹介します!
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【抗体デザイン】AbDiffuser:拡散モデルでHER2抗体の配列を再設計

APMixer というアーキテクチャを利用した抗体のリデザイン手法について紹介します!
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【AlphaFold】抗体・抗原複合体予測の最新ベンチマーク

AlphaFold による抗体・抗原複合体モデルの予測精度について検証した論文を紹介します!
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【抗体デザイン】既存の学習モデルを再活用、モデルリプログラミングとは

モデルリプログラミング (MR) という手法を使って抗体の CDR デザインを試みた文献を紹介します!
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“graph neural PDE”で抗原結合抗体をデザイン、AbODEについて

抗原結合できる抗体の CDR を、計算機上でデザインできる AbODE という手法を紹介します!
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【抗体デザイン】AfDesignで抗体をデザイン!

AfDesign による "binder hallucination"を、抗体のCDRデザインに適用した事例を紹介します!
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【抗体デザイン】抗体の開発戦略全書

抗体医薬品の分子デザインに関わる技術をレビューした文献を紹介します!
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【抗体言語モデル】構造情報を取り入れた抗体の言語モデルAbMAPでAF2越え

抗体構造情報を活用して、タンパク質言語モデルを転移学習させたモデル、AbMAP を紹介します!
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【抗体デザイン】一般的なタンパク質言語モデルでも、抗体の親和性増強は可能なのです

タンパク質配列を学習した自然言語モデルを、抗体の分子進化に適用した論文を紹介します!