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【抗体デザイン】Dock&Optimizeで、ゼロからIL-17Aに結合する抗体をデザインする手法

Dock and Optimize アプローチを採用した抗体のデノボデザイン手法を紹介します。
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【抗体デザイン】複合体構造がなくても、標的抗原に結合する抗体がデザインできる手法”dyMEAN”を紹介します

end-to-endで抗原に結合する抗体のH3をデザインする手法、dyMEANを開発を紹介します。
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【ALL】病因・疫学・診断・治療

ALLの病因・疫学・診断・治療について解説します。
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【細胞治療】造血幹細胞移植×抗体療法

造血幹細胞移植の前処理に使用される、抗体療法について紹介します。
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【抗体】新しい深層生成モデルでH3配列をサンプリング

multi-segment preserving samplingという深層生成モデルを提案して、抗体のH3デザインに応用した論文です。
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【BERT】SAR2-CoV-2 binderを深層学習で予測!AlphaSeqデータを用いたモデル学習

SAR2-CoV-2 binderを予測する深層学習モデルについて紹介します。
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【抗体デザイン】BERTとGNNを組み合わせた抗体のデザイン手法、AbBERT-HMPNとは

BERTとHMPNを接続して抗体のH3をデザインする手法、AbBERT-HMPNを紹介した論文を紹介します。
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【Pre-taining Language Model】抗体の事前学習言語モデルを総括!

抗体に特化した既知の自然言語事前学習モデル(Pre-trained Antibody Language Models, PALM) についてベンチマークし、一般的なタンパク質を訓練データとする事前学習モデル (Pre-trained Protein Language Models, PPLM) との違いについて考察した論文を紹介します。
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【抗体デザイン】抗原に結合するH3をデノボでデザインできる手法が深層学習でついに誕生!

CDRの配列と3次元構造を同時に生成できるモデルMEANを紹介します。
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“Structured interaction motifs”で、抗原抗体相互作用を低次元に表現

Structural interaction motifsと呼称する独自の表現方法で、抗原抗体相互作用の特徴を低次元で効率的に表すことを試みた論文を紹介します。