Articles 【de novoデザイン】「抗体」に「幻覚」を、FvHallucinatorの概要について
抗体配列をデザインする手法、FvHallucinatorを提案した論文を紹介します。
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Articles Articles 【構造予測】RoseTTAFoldを抗体構造予測に適応すると・・・
タンパク質構造予測のための深層学習モデルRoseTTAFoldを、抗体の構造予測に適応したときの予測精度を、従来のホモロジーモデリング手法と比較評価した論文を紹介します。
Articles 【構造予測】VHH抗体のin silico構造予測手法まとめ
VHHの構造予測手法についての総説を紹介します。
Articles 【エピトープ予測】深層学習モデルを利用した抗体エピトープ予測手法を解説
抗体のエピトープを、既存の構造データセットを利用した深層学習モデルを活用して、予測する手法を提案している論文を紹介します。
Articles 【ドッキング】実験情報を活用したタンパク質ドッキングシミュレーション手法（原著編）
事前に取得したエピトープ情報をもとに、抗体・抗原複合体構造のドッキングモデルを作成する手法について紹介します。
Articles 【ドッキング】抗体・抗原相互作用における各ドッキングシミュレーション手法の精度を徹底比較
ドッキングシミュレーションの精度検証のためのベンチマークデータセットの作成と、それを用いた各ドッキングアルゴリズムの精度比較検証結果を紹介します。
Articles 【抗体】従来のカノニカル構造を超える、構造情報を活用した新規CDR分類
抗体(CDR)の新規な分類データセットを紹介した論文を紹介します。
Articles 【抗体モデリング】抗体に特化した側鎖構造予測手法PEARSについて
抗体の側鎖構造を予測するツールであるPEARSを紹介します。
Articles 【抗体スクリーニング】天然配列へのback mutationで、抗体のdevelopabilityが改善
不溶性を示す物性の悪い抗体に対して、計算予測で物性を改善する変異体のデザインに成功した論文を紹介します。
Articles 【抗体エンジニアリング】抗体のdevelopabilityに関与する物性指標とは
メルクの非臨床における抗体スクリーニングのプラットフォームと、それを活用した各種物性評価指標の相関に関する解析結果を紹介します。