Articles 【抗体デザイン】マスク言語モデルを用いた抗体の配列設計モデルを紹介! マスク言語モデルを利用したタンパク質の配列設計手法を紹介します!抗原結合を伴う抗体の配列設計への適用を試みています。 2024.01.29 Articles
Articles 【抗体デザイン】ついにウェット試験で結合活性を示す抗体CDRをインシリコでデザイン! IgDesign という手法で、抗原結合抗体をインシリコでデザインし、ウェットでその結合活性を確認した事例を紹介します! 2024.01.23 Articles
Articles 抗体ペアリングの新時代:エンコーダー・デコーダーモデルpAbT5の可能性 抗体の重鎖または軽鎖に対応するペア配列を生成できるモデル、pAbT5 を紹介します! 2024.01.20 Articles
Articles 【抗体デザイン】高度に類似した抗原に対して特異的なバインダーをインシリコでデザインするには ファージディスプレイパニングで得られた配列情報を活用して訓練した機械学習モデルをもとに、訓練データに含まれていない仮想配列の抗原結合特性を予測する手法を紹介します! 2023.11.29 Articles
Articles 【抗体デザイン】Transformer で標的抗原に結合する抗体HCDR3をデザインする手法 望みの抗原に結合する CDRH3 を生成する PALM と、エピトープ配列と抗体配列から結合親和性を予測するモデル(A2binder)を紹介します! 2023.11.28 Articles
Articles 【抗体デザイン】多様な Ig ドメインライブラリを計算機で生成してみたところ・・・ 安定で構造多様性のある、イムノグロブリンスキャフォールドライブラリを計算機でデザインした論文を紹介します! 2023.11.10 Articles
Articles 【抗体デザイン】拡散モデルを用いた “State-of-the-art” のデザイン手法を紹介します! 抗体の配列設計手法 AbDesignと、抗原ドッキング手法 AbDock を用いて、抗体の構造予測や抗原親和性増強をおこなう手法を紹介します! 2023.10.29 Articles
Articles 【抗体スクリーニング】不要なエピトープバインダーを取り除くデコイタンパク質デザインのコツ 標的エピトープに結合するバインダーを、優先的にスクリーニングで選抜するための方法論を紹介します! 2023.10.23 Articles
Articles 【抗体】インフルエンザ抗体のエピトープを予測する言語モデル mBLM について 抗体データセットに基づく深層学習大規模言語モデルを活用して、抗インフルエンザ HA 抗体の特性理解やエピトープ予測を行う手法を紹介します! 2023.10.17 Articles