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【AlphaFold】バインダーデザインの精度を向上させるAF2とProteinMPNNの役割

AF2やProteinMPNNを使うことで、バインダーのデザイン精度を向上させることができることを実証しています。
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【BERT】SAR2-CoV-2 binderを深層学習で予測!AlphaSeqデータを用いたモデル学習

SAR2-CoV-2 binderを予測する深層学習モデルについて紹介します。
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【抗体デザイン】BERTとGNNを組み合わせた抗体のデザイン手法、AbBERT-HMPNとは

BERTとHMPNを接続して抗体のH3をデザインする手法、AbBERT-HMPNを紹介した論文を紹介します。
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【抗体デザイン】抗原に結合するH3をデノボでデザインできる手法が深層学習でついに誕生!

CDRの配列と3次元構造を同時に生成できるモデルMEANを紹介します。
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反復らせん構造に基づくペプチドバインダーデザイン

反復したらせん構造の主鎖骨格を使って、ペプチド結合領域をデザインする手法を紹介します。