Articles 【ProteinMPNN】配列再設計でタンパク質の発現量を改善するコツ ProteinMPNN を利用した配列再設計で、天然タンパク質の機能や熱安定性、発現量を改善した実施例を紹介します! 2023.11.07 Articles
Articles 【抗体デザイン】拡散モデルを用いた “State-of-the-art” のデザイン手法を紹介します! 抗体の配列設計手法 AbDesignと、抗原ドッキング手法 AbDock を用いて、抗体の構造予測や抗原親和性増強をおこなう手法を紹介します! 2023.10.29 Articles
Articles 【抗体スクリーニング】不要なエピトープバインダーを取り除くデコイタンパク質デザインのコツ 標的エピトープに結合するバインダーを、優先的にスクリーニングで選抜するための方法論を紹介します! 2023.10.23 Articles
Articles 【バインダーデザイン】光で結合活性を制御できるDARPinを計算機デザイン 光でバインダーの結合活性を制御する、タンパク質スイッチシステムを紹介します! 2023.10.14 Articles
Articles 【抗体デザイン】インシリコデザインで、高度な特徴量の解析は不要 言語モデルとファージディスプレイパニングのデータを活用して、抗体の親和性増強のための改変探索を行う手法を紹介します! 2023.10.12 Articles
Articles アミノ酸配列のみを用いた拡散生成モデルでタンパク質をデザインする手法 EvoDiff とは タンパク質のアミノ酸情報のみを用いて構築された、タンパク質の拡散生成モデル EvoDiff について紹介します! 2023.10.10 Articles
Articles 【タンパク質デザイン】”ダークマター”タンパク質の実体とデザイン手法について 低解像度の構造モチーフを文字列形式で表現した「Sketch」と、それを設計可能なフォールディングに修正するVAEモデル「Genesis」を活用することで、非天然のデノボ構造(=ダークマタータンパク質)を設計する手法について紹介します! 2023.10.03 Articles
Articles 【タンパク質デザイン】ヘリックス・ループの反復骨格構造を利用して、バインダーをデザインする方法 本研究は、DARPins のようなヘリックス・ループの反復構造を骨格としたタンパク質 (RBL) を計算機でデザインした報告を紹介します! 2023.09.26 Articles
Articles 【タンパク質デザイン】合理的にシードを生成するヘリックスバレル構造のデザイン ヘリックスバンドル構造から新たなヘリックスを接続することで、ヘリックスバレル構造を合理的にデザインする手法を紹介します! 2023.09.23 Articles