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【AI学習】初心者でも学べるAIタンパク質設計手法の教育用ノートブック DL4Proteins とは

AI×タンパク質設計の最先端ツール(RFDiffusion・ProteinMPNN・AlphaFold2 など)を誰でも学べるよう体系化した「教育用ノートブック(10本)」を紹介します!
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【タンパク質デザイン】Multi-Step Diffusion による Hallucination デザイン手法 Protein Hunter とは

構造予測モデルのハルシネーション能力を逆利用して、構造と配列を同時に最適化する新しい protein design フレームワーク、Protein Hunter を紹介します!
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【抗体デザイン】Prescient Design の抗体ループトークナイザー IGLOO とは

抗体の CDR ループ構造(Complementarity-Determining Regions) を対象とした マルチモーダル・トークナイザー、IGLOO を紹介します!
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【Novokine】FGFR/HER2 の人工的な近接化アゴニストをデノボで設計

HER2とFGFRという自然界では結合しない受容体を人工的に近接させる「設計型アゴニスト(Novokine)」H2F を用いて、線維芽細胞を筋細胞へと直接転換(reprogramming)することに成功した報告を紹介します!
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【抗体デザイン】in silico で共通L鎖を設計する方法

AI駆動の構造予測と設計手法を用いて bispecific antibody (BsAb) の製造上の最大の課題である light chain (LC) mispairing を解決する方法を紹介します!
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【Synthekine】デノボデザインで人工サイトカインを創成した研究を紹介

de novoタンパク質設計を用いて人工サイトカイン様分子(Novokines)を大量生成し、その免疫シグナル活性を網羅的にマッピングした研究を紹介します!
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【タンパク質デザイン】リン酸化ペプチドバインダーを設計できる RFDの拡張版 RFD2-MI とは

RFDiffusion2を拡張してリン酸化依存的タンパク質結合分子を設計可能にした研究を紹介します!
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【タンパク質デザイン】Baker研から汎用的なpH依存性バインダーの設計手法が公開

pHに応答して結合力が変化するタンパク質バインダーを、計算設計によって創出する方法を初めて体系化した研究を紹介します!
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【バインダーデザイン】HPC で効率的にタンパク質を設計できるデザインパイプライン ProteinDJ を紹介

高性能計算環境(HPC)上で効率的に動作する新しいタンパク質設計パイプライン「ProteinDJ」を紹介します!
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【抗体デザイン】Manifold Bio が発表、最新の抗体デザインシステム mBER とは

Manifold Bio が発表した mBER という新しい抗体デザインシステムを紹介します!