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Fold2Seqを抗体デザインに適用

Fold2Seqを抗体デザインに適用した事例を紹介します。
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Equivariant Neural Networksで抗体デザインに挑戦

抗原・抗体複合体のドッキング予測とデザインのため、Hierarchical Equivariant Refinement Network (HERN)を提案した論文を紹介します。
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【抗体デザイン】”Active Learning”を使って抗体設計に挑戦

抗体工学の予測・生成モデルに"active learning"を利用した実施例です。
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【抗体デザイン】拡散モデルを使って、抗原結合抗体をデノボデザイン

拡散モデルを用いた抗体のデザイン手法を提案している論文です。
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【抗体デザイン】抗体の構造・配列生成を反復的に精緻化する手法、RefineGNNについて

抗体の構造・配列生成を反復的に精緻化する手法、RefineGNNを紹介します。
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【抗体デザイン】Q学習を利用したH3の抗体最適化手法を紹介

Q学習による深層強化学習を利用して、抗体のデザインを試みた論文を紹介します。
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【de novoデザイン】ProteinSolverでデザインしたタンパク質をAlphaFold2で構造予測

ProteinSolverを用いてデザインしたタンパク質の評価指標の1つとして、AlphaFold2による予測構造を利用したデザイン事例を紹介します。
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【抗体デザイン】OptMAVEn-2.0で、SARS-CoV-2抗体をデザイン

OptMAVEn-2.0を用いた抗体デザインの実施例として、SARS-CoV-2 RBDに対する結合抗体の取得事例を紹介します。
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【抗体デザイン】ベイズ最適化を利用した抗体最適化手法AntBOについて

ベイズ最適化で高親和性抗体を計算機デザインする手法、AntBOについて紹介します。
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【de novoデザイン】タンパク質の2次構造をパラメータで表現する

"protein universe"と呼ばれるタンパク質構造の空間の中で、未開拓な構造や機能を探索する方法についてレビューした論文を紹介します。