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大規模データセットを用いたタンパク質安定性予測手法

タンパク質の熱安定性を予測する言語モデル「ESM_therm」を紹介します!
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【タンパク質構造解析】CASP15で好成績を収めたDeepFoldを深掘り!

DeepFold という名の新しいタンパク質構造予測モデルについて紹介します!タンパク質の側鎖とバックボーンの精度を高めるために、損失関数とテンプレート機能、エネルギー関数に最適化の工夫がみられます。
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【タンパク質構造予測】単一配列からのタンパク質構造予測におけるColabFoldの革新

本論文では、ColabFold に標的のタンパク質配列を投げるだけで、タンパク質の代替構造を予測できることを示した論文を紹介します!
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現在の結合親和性予測モデルは、どんな特徴を学習しているのか

結合親和性予測のための既存の機械学習モデルが、どのような特徴量を用いて親和性を予測しているのか、そのメカニズムについて解析した論文を紹介します!
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【RFDiffusion】バインダーデザインにおけるAF2スクリーニングのコツ

RFDiffusionでバインダーデザインするときのコツを紹介します!
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タンパク質言語モデルの民主化:効率的なパラメータファインチューニング

タンパク質言語モデルに対するパラメータ効率的なファインチューニング手法を紹介します!
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Umolによる配列情報からのタンパク質-リガンド複合体の構造予測

Umol は、タンパク質の配列とリガンドを表す SMILES 文字列から、タンパク質-リガンド複合体の全原子構造を予測する AI システムを紹介します!
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多重配列アラインメントを使用しないタンパク質構造予測の新手法

PLM と AlphaFold の手法を活用したタンパク質構造予測モデル HelixFold を紹介します!
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【タンパク質デザイン】リガンドペプチドでタンパク質の集積化を誘導

リガンドペプチドの結合によって、タンパク質間の集積化を誘導できるタンパク質のデザイン事例を紹介します!
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【タンパク質デザイン】Chroma のコードが公開されました!

タンパク質のデザイン手法 Chroma の公開コードについて紹介します!