Articles 【タンパク質デザイン】”ダークマター”タンパク質の実体とデザイン手法について
低解像度の構造モチーフを文字列形式で表現した「Sketch」と、それを設計可能なフォールディングに修正するVAEモデル「Genesis」を活用することで、非天然のデノボ構造（＝ダークマタータンパク質）を設計する手法について紹介します！
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Articles Articles 【タンパク質デザイン】ヘリックス・ループの反復骨格構造を利用して、バインダーをデザインする方法
本研究は、DARPins のようなヘリックス・ループの反復構造を骨格としたタンパク質 (RBL) を計算機でデザインした報告を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】合理的にシードを生成するヘリックスバレル構造のデザイン
ヘリックスバンドル構造から新たなヘリックスを接続することで、ヘリックスバレル構造を合理的にデザインする手法を紹介します！
Articles 【タンパク質モデリング】Rosetta では、モデル膜の種類に応じて膜タンパク質の構造を調整できます
Rosetta の膜構造のモデリングフレームワークの改良を報告した論文を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】環状ペプチドのデザインも AfDesign で。
AfDesign を利用して、標的抗原に結合する環状ペプチドをデザインした論文を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】新しいタンパク質デザイン手法、 CPDiffusion とは
タンパク質に適用できる拡散生成モデル CPDiffusion について紹介します！
Articles 【レビュー】機械学習とタンパク質工学。
タンパク質工学に機械学習を用いる価値について、レビューした総説を紹介します！
Articles 【AlphaFold】AlphaFold-multimer の予測精度を高める AFProfile の威力
AlphaFold の複合体構造を予測するモードである AlphaFold-multimer の予測精度を高めるための方法について紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】配列モデルからペプチドバインダーデザイン
タンパク質の配列データを学習セットとして構築されたペプチドバインダーデザインモデルについて紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】蛍光スプリットタンパク質システムのタンパク質工学的な視点からの考察
スプリットタンパク質を用いた２分子蛍光分析法についてレビューした論文を紹介します！