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【タンパク質デザイン】タンパク質の粗視化表現を活用したデザイン手法を紹介します!

タンパク質の新規表現手法CGトポロジーを用いて、タンパク質を設計する手法について紹介します!
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【配列デザイン】超高速に配列デザイン可能な PiFoldを紹介!

タンパク質の新規配列デザイン手法 PiFold について解説します!
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【配列デザイン】低分子結合まで応用範囲を拡大! LigandMPNN とは

低分子リガンドに結合するタンパク質の配列設計ができる深層学習モデル、LigandMPNN について紹介します!
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デノボタンパク質デザインにより、ナノポアタンパク質のサイズと形状を自由自在に

新規プロテインデザインを使用して、特定のサイズと形状を持つ伝導性ナノポアを創出した研究を紹介します!
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【FragFold】AlphaFoldを使用した阻害タンパク質断片の高速計算手法を開発!

AlphaFold を用いてタンパク質断片がターゲットタンパク質に結合・阻害するかどうかを予測する新しい方法、FragFold について紹介します!
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リガンド結合部位を予測する DeepProSite について解説します!

タンパク質のリガンド結合部位を予測する手法 DeepProSite について紹介します!
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【タンパク質デザイン】構造配列プロファイルを活用した配列設計の新規手法 SPDesign とは

逆折り畳み問題を解く新規手法である SPDesign を紹介します!
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大規模データセットを用いたタンパク質安定性予測手法

タンパク質の熱安定性を予測する言語モデル「ESM_therm」を紹介します!
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【タンパク質構造解析】CASP15で好成績を収めたDeepFoldを深掘り!

DeepFold という名の新しいタンパク質構造予測モデルについて紹介します!タンパク質の側鎖とバックボーンの精度を高めるために、損失関数とテンプレート機能、エネルギー関数に最適化の工夫がみられます。
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【タンパク質構造予測】単一配列からのタンパク質構造予測におけるColabFoldの革新

本論文では、ColabFold に標的のタンパク質配列を投げるだけで、タンパク質の代替構造を予測できることを示した論文を紹介します!