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【バインダーデザイン】低分子リガンド依存的な On-Switch バインダーがデザインできる、MaSIF の新規手法を紹介

低分子リガンドが結合したタンパク質表面をエピトープとするバインダーの設計手法 MaSIF-neosurf を紹介します!
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【大規模データ】ヒトタンパク質の変異体を網羅解析!

ヒトタンパク質の改変体に対する安定性を網羅的に調べたデータを取得し、その特徴を解析した論文を紹介します!
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【レビュー論文】タンパク質エンジニアリングのための深層学習手法総まとめ

タンパク質デザインに関連した深層学習手法をまとめたレビュー論文を紹介します!
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【バインダーデザイン】ファージディスプレイの Enrichement ratio と true binder との相関性について

Inverse folding model を用いた Insulin receptor バインダーデザインの実施例を紹介します!
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【タンパク質デザイン】柔軟性の高い配列を生成できる ProteinMPNN の改良モデル、Flexpert を紹介!

タンパク質の柔軟性を予測し、柔軟性の高い配列を設計する手法 Flexpert を紹介します!
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【バインダーデザイン】peptide-MHC バインダーにはデノボスキャフォールドがおすすめ

peptide-MHC に対するバインダーをデノボで設計した実施例を紹介します!
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【抗体デザイン】計算機デザインパイプライン EvolveX で Vsig4 VHH バインダーを最適化

抗体の最適化パイプライン EvolveX を紹介します!
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【RFpeptide】RFDiffusion を利用した環状ペプチドデザインで single nM のバインダー取得に成功

RFDiffusion を用いた環状ペプチド設計で、実験的にバインダーを設計できることを証明した論文を紹介します!
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【ペプチドデザイン】環状ペプチドを RFDiffusion で設計する方法

RFDiffusion を利用した環状ペプチド設計手法を紹介します!
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【抗体抗原結合予測】AlphaSeq データを使用した抗原結合予測の事前学習モデル AlphaBind について

抗体の抗原結合活性を予測するモデル AlphaBind について紹介します!