【今週の構造】生き残る種とは、、

格言

It is not the strongest of the species that survives, nor the most intelligent that survives. It is the one that is most adaptable to change.

生き残る種とは、最も強いものでも、最も知的なものでもない。それは、変化に最もよく適応したものである。

Darwin

アミノ酸配列

ITISNQTTHESTRQNGESTQFTHESPECIESTHATSVRVIVESNQRTHEMQSTINTELLIGENTTHATSVRVIVESITISTHEQNETHATISMQSTADAPTADLETQCHANGE

変換ルール

• 以下のアルファベットは、アミノ酸1文字表記が存在しないため、下記のとおり変換
• 記号は削除

• B　→　D
• J　→　I
• O　→　Q
• U　→　V
• X　→　Y
• Z　→　N

構造予測

ColabFold: AlphaFold2 using MMseqs2

settings

• msa_mode: MMseqs(Uniref+Environmental)
• model_type:auto
• pair_mode: unpaired+paired
• num_recycles:3

構造モデル

出力モデル

出力結果