【今週の構造】great ocean of truth

格言

I was like a boy playing on the sea-shore, and diverting myself now and then finding a smoother pebble or a prettier shell than ordinary, whilst the great ocean of truth lay all undiscovered before me.

私は、海辺で遊んでいる少年のようである。ときおり、普通のものよりもなめらかな小石やかわいい貝殻を見つけて夢中になっている。真理の大海は、すべてが未発見のまま、目の前に広がっているというのに。

Isaac Newton
ニュートンの名言・言葉(英語&日本語) | 名言+Quotes
万有引力の発見、アイザック・ニュートンの名言集、格言。英文もご紹介。「学べる・活かせる名言集!」

アミノ酸配列

IWASLIKEADQYPLAYINGQNTHESEASHQREANDDIVERTINGMYSELFNQWANDTHENFINDINGASMQQTHERPEDDLEQRAPRETTIERSHELLTHANQRDINARYWHILSTTHEGREATQCEANQFTRVTHLAYALLVNDISCQVEREDDEFQREME

変換ルール

  • 以下のアルファベットは、アミノ酸1文字表記が存在しないため、下記のとおり変換
  • 記号は削除
  • B → D
  • J → I
  • O → Q
  • U → V
  • X → Y
  • Z → N

構造予測

ColabFold: AlphaFold2 using MMseqs2
settings
  • msa_mode: MMseqs(Uniref+Environmental)
  • model_type:auto
  • pair_mode: unpaired+paired
  • num_recycles:3

構造モデル

出力モデル

出力結果

1つの鎖を後ろから巻いていくような構造。何周かできれば、人工のスキャフォールドに使える??

コメント