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【抗体デザイン】Baker 研から pMHC に対する抗体バインダー設計手法が公開

pMHC(peptide–MHC)を標的とする TCR と抗体を計算設計するための新しいフレームワーク ADAPT を紹介します!
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【抗体デザイン】Nabla bio の最新抗体生成モデル JAM-2 の性能を紹介

JAM-2 という Nabla Bio の抗体生成モデルが、従来の de novo 抗体設計では到達できなかった基準を満たすことを実証した報告です!
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【AI学習】初心者でも学べるAIタンパク質設計手法の教育用ノートブック DL4Proteins とは

AI×タンパク質設計の最先端ツール(RFDiffusion・ProteinMPNN・AlphaFold2 など)を誰でも学べるよう体系化した「教育用ノートブック(10本)」を紹介します!
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【タンパク質デザイン】Multi-Step Diffusion による Hallucination デザイン手法 Protein Hunter とは

構造予測モデルのハルシネーション能力を逆利用して、構造と配列を同時に最適化する新しい protein design フレームワーク、Protein Hunter を紹介します!
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【抗体デザイン】Prescient Design の抗体ループトークナイザー IGLOO とは

抗体の CDR ループ構造(Complementarity-Determining Regions) を対象とした マルチモーダル・トークナイザー、IGLOO を紹介します!
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【Novokine】FGFR/HER2 の人工的な近接化アゴニストをデノボで設計

HER2とFGFRという自然界では結合しない受容体を人工的に近接させる「設計型アゴニスト(Novokine)」H2F を用いて、線維芽細胞を筋細胞へと直接転換(reprogramming)することに成功した報告を紹介します!
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【タンパク質デザイン】全原子生成モデル BlotzGen でバインダーを設計

あらゆる種類の生体分子(タンパク質、ペプチド、ナノボディ、小分子、RNAなど)を標的とする汎用バインダー設計モデルである BoltzGen を紹介します!
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【抗体DB】機械学習に適した抗体・抗原PPIデータベース NAStructuralDBを紹介!

抗体・ナノボディ・抗原・一般タンパク質複合体を対象に、構造的・相互作用的特徴を網羅的にアノテーションした新しい構造データベース「NAStructuralDB」を紹介します!
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【抗体スクリーニング】MDによる抗体・抗原相互作用のスクリーニング法まとめ

抗体と抗原ペプチド間の結合親和性を計算的に評価する手法の精度と実用性を比較検証した研究を紹介します!
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【抗体デザイン】in silico で共通L鎖を設計する方法

AI駆動の構造予測と設計手法を用いて bispecific antibody (BsAb) の製造上の最大の課題である light chain (LC) mispairing を解決する方法を紹介します!