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タンパク質構造予測のための深層学習モデルRoseTTAFoldを、抗体の構造予測に適応したときの予測精度を、従来のホモロジーモデリング手法と比較評価した論文を紹介します。
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Articles 【de novo design】TERMを組み合わせてバインダーをデザインする方法
「tertiary motifs(TERM)」を組み合わせることで、標的タンパク質に結合する分子をin silicoでデザインする手法を紹介します。
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「Image Outpainting」の手法を利用して、タンパク質をデザインした報告を紹介します。
Articles 【AlphaFold】複合体構造予測手法を利用して、複数のバインダーから高親和性の分子を同定
AlphaFoldを利用して、分子の競合的な結合の確認や、競合分子同士の親和性比較ができることを示した論文を紹介します。
Articles 【de novo design】またしてもタンパク質デザインのレビューを読み解く②
タンパク質のin silico構造予測・デザイン手法をまとめた総説を紹介します。この記事では、デザインを中心に解説します。
Articles 【de novo design】またしてもタンパク質デザインのレビューを読み解く①
タンパク質のin silico構造予測・デザイン手法をまとめた総説を紹介します。この記事では、構造予測を中心に解説します。