Articles 【Baker Lab】デノボデザインタンパク質のハイスループットスクリーニングシステム
高速かつ低コストで多数のタンパク質を発現・精製・特性評価する新規プロトコルを紹介します！
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Articles 【バインダーデザイン】RFDiffusion で線形ペプチドのバインダー設計
ポックスウイルスの主要膜タンパク質 F13L を標的に、RFdiffusion を用いて新規ペプチド阻害剤を計算設計した研究です！
Articles 【AIエージェント】SARS-CoV-2バインダーを自動で設計する AI エージェントシステムを紹介
大規模言語モデル（LLM）を用いた多エージェントAIシステム「Virtual Lab」により、新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の新規ナノボディ（抗体）の設計と実験検証を実現した実施例を紹介します！
Uncategorized 【バインダーデザイン】EvoBind で GPCR アゴニストを設計した事例を紹介
構造情報を一切使わず、配列情報のみからGタンパク質共役受容体（GPCR）に作用する環状ペプチドアゴニストを設計する初の成功例を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】AF3 から RFDiffusion まで HPC で扱えるコンテナを紹介
AlphaFold3 や RFdiffusion などの実用化を目的とした、コンテナ化とマルチモデル統合プラットフォーム（OmniFold）の開発について解説します！
Articles 【構造予測】フォールドスイッチタンパク質のデザイン
AlphaFold2（AF2）を使ってタンパク質の異なる構造状態（とくにフォールドスイッチ）を予測し、それを安定化させるための変異を設計する手法を紹介します！
Articles 【バインダーデザイン】非天然アミノ酸を有するペプチドバインダーを設計できる EvoBindRare を紹介！
非天然アミノ酸（noncanonical amino acids, NCAAs）を含むタンパク質の構造予測とデザインを目的とした深層学習モデル「RareFold」を紹介します！
Articles 【CPPデザイン】アミノ酸配列からCPPを予測する PERSEUcpp を紹介！
細胞透過性ペプチド（CPPs）の細胞内取り込み効率を機械学習で予測する新手法「PERSEUcpp」を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】リン酸化に応答して細胞骨格フィラメントを形成するデノボタンパク質をデザイン！
デノボ設計によって制御可能な多成分性タンパク質フィラメント（繊維状構造体）を創製する新技術を紹介します！
Articles 【バインダーデザイン】構造いらずのペプチドバインダーデザイン手法 PepPrCLIP とは
従来の構造依存的なアプローチを必要とせずに、配列情報のみから新規ペプチド結合分子（binder）を設計するためのフレームワーク「PepPrCLIP」を紹介します！