Articles マルチエージェントとパレート最適化で挑む、構造と機能を両立するタンパク質設計
構造安定性と機能性という相反しやすい設計目標を同時に最適化するために、複数のタンパク質設計モデルを協調させるマルチエージェントフレームワーク「MAProt」を紹介します！
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Articles 生成AI「Origin-1」による de novo 抗体設計の実証研究
ゼロ情報エピトープに対する抗体設計という難題に、生成AIでどこまで迫れるのかを実験的に示した研究を、初学者向けに解説します！
Articles ProtBFFによるタンパク質間結合ΔΔG予測の改善
本論文では、タンパク質間結合自由エネルギー変化（ΔΔG）予測において、既存データセットの問題点を明らかにし、生物物理的特徴を明示的に取り入れる新しい枠組み「ProtBFF」を紹介します！
Articles 400万抗体で検証! FLAb2ベンチマークの結果について
抗体AIはどこまで「開発しやすさ」を見抜けるのか――400万抗体を用いたFLAb2ベンチマークが、その現実的な限界を明らかにした論文です。
Articles 【抗体デザイン】contrastive learning を活用した反復抗体設計手法 HyperBind2 を紹介
「失敗から賢くなる抗体探索プロセス」を実現する抗体設計モデル HyperBind2 を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】T-cell engager の分子形もインシリコで最適化
高スループット機能アッセイと多目的ベイズ最適化を閉ループ統合し、抗原密度依存 avidity を設計原理として HER2×CD3 TCE の完全選択的活性を実現した論文を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】デノボデザインの統合パイプライン Ovo の構想とは
Ovo という、RFdiffusion 時代の de novo タンパク質設計を「個人芸」から「再現可能な工学プロセス」へ昇格させるための実践的オープンソース基盤を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】抗体最適化のための強化学習最新手法を紹介！
可変長CDRインフィリングが可能な抗体LLM（IgLM）に、オンラインRL（PPO+KL）とオフラインRL（DRO）を統合し、「構造指標」と「実験データ」の両方で機能最適化できる枠組みを紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】PROTACのデノボデザイン事例を紹介
de novo 設計した小型タンパク質を タンパク質版 PROTAC として使い、BCL-xL を細胞内で分解し、アポトーシスを誘導できることを実証した論文を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】Sparse Autoencoder (SAE) を利用して抗体 LLM の理解を深める
抗体言語モデル（p-IgGen）の内部表現を Sparse Autoencoder（SAE）で分解することで、「解釈できる特徴」と「生成を実際に制御できる特徴」は別物であることを示した論文を紹介します！