Articles 【de novoデザイン】トランスフォーマーベースの深層学習モデルでタンパク質デザイン
大規模なタンパク質の構造データベースからモデルを構築して、天然のタンパク質の特徴を持ちながら進化的に無関係な配列を生成する手法(ProtGPT2)を紹介します。
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Articles Articles 【抗体】機械学習を活用した、抗体の開発適性評価手法まとめ
機械学習を活用した抗体デザイン手法をまとめたレビュー論文を紹介します。
Articles 【de novoデザイン】「抗体」に「幻覚」を、FvHallucinatorの概要について
抗体配列をデザインする手法、FvHallucinatorを提案した論文を紹介します。
Articles 【de novo design】ついにバインダーデザインが深層学習でも可能に
タンパク質間相互作用モチーフをデザインための、イメージキャプションアルゴリズムを利用した深層学習手法iNNterfaceDesignを紹介します。
Articles 【de novoデザイン】人工ミニプロテインをde novoデザインして、ウイルス中和分子を作製
インフルエンザウイルスタンパク質(HA)とボツリヌス毒素タンパク質(BoNT)に対して結合する、低分子量のタンパク質のde novoデザインに成功したことを報告した論文を紹介します。
Articles 【de novoデザイン】世界初！βバレル構造の蛍光タンパク質をin silicoデザイン
低分子の結合に応答して蛍光を発するβバレルタンパク質を、de novoデザインした報告について紹介します。
Articles 【de novoデザイン】SARS-CoV-2スパイクタンパク質を中和する分子をin silicoでデザイン
in silicoでSARS-CoV-2スパイクタンパク質に対する結合分子をデザインした報告を紹介します。
Articles 【de novo design】タンパク質の主鎖原子構造に着目した「van der Mer」を利用して、低分子に結合するタンパク質をデザイン
タンパク質の主鎖原子構造に着目した「van der Mer」を利用して、「低分子」に結合するタンパク質をde novoデザインした論文を紹介します。
Articles 【de novo design】TERMを組み合わせてバインダーをデザインする方法
「tertiary motifs(TERM)」を組み合わせることで、標的タンパク質に結合する分子をin silicoでデザインする手法を紹介します。
Articles 【de novo design】「Image Outpainting」を応用したタンパク質のデザイン手法を紹介
「Image Outpainting」の手法を利用して、タンパク質をデザインした報告を紹介します。