Articles 配列と構造を同時に最適化するとはどういうことか？―安定なde novoタンパク質設計に向けた「joint optimization」の考え方
配列と構造を同時に最適化することで、より安定なde novoタンパク質設計が可能になることを、大規模実験データで示した研究の解説記事です！
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Articles マルチエージェントとパレート最適化で挑む、構造と機能を両立するタンパク質設計
構造安定性と機能性という相反しやすい設計目標を同時に最適化するために、複数のタンパク質設計モデルを協調させるマルチエージェントフレームワーク「MAProt」を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】contrastive learning を活用した反復抗体設計手法 HyperBind2 を紹介
「失敗から賢くなる抗体探索プロセス」を実現する抗体設計モデル HyperBind2 を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】抗体最適化のための強化学習最新手法を紹介！
可変長CDRインフィリングが可能な抗体LLM（IgLM）に、オンラインRL（PPO+KL）とオフラインRL（DRO）を統合し、「構造指標」と「実験データ」の両方で機能最適化できる枠組みを紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】PLM や Diffusion モデルを「ガイド」する方法を総まとめ
生成AI（GMPDs: Generative Models for Protein Design）を「望む性質をもつタンパク質を作る方向にコントロールする方法」を体系的に整理したレビューを紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】pLM を DPO で条件付けする方法
タンパク質言語モデル (pLMs) に強化学習 (RL) を組み合わせることで、従来の限界を突破し、狙った性質を持つタンパク質配列を効率的に設計する手法 DPO_pLM を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】pLM の確率分布からから直接サンプリングする抗体最適化設計手法 ALLM-Ab とは
アクティブラーニング × 言語モデル微調整による抗体最適化フレームワークである ALLM-Ab を紹介します！
Articles 【抗体最適化】 Prescient Design の拡散モデルベースの抗体最適化手法 LaMBO-2 について解説
Discrete Diffusion Model を活用した抗体最適化手法 LaMBO-2 を紹介します！
Articles 【抗体最適化】ベイズ最適化を活用した多目的最適化手法を解説
Constrained Bayesian Optimization を活用して抗体の多目的最適化を実現するための手法を紹介します！
Articles 【抗体最適化】AlphaFlow を活用した抗体親和性増強モデル AffinityFlow とは
抗体の親和性を増強する配列生成法 AffinityFlow を紹介します！