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タンパク質の「フォールド」から「配列」を生成

タンパク質の「フォールド」から「アミノ酸配列」を予測する手法、Fold2Seqを紹介します。
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【抗体デザイン】免疫ライブラリを使って、結合抗体を分類・生成する深層学習モデル

抗体のスクリーニングデータを使って、抗原結合抗体を分類・生成するモデルを紹介します。
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【タンパク質構造解析】タンパク質構造を「周期表」で表現

タンパク質の構造レパトアを、周期表としてまとめる方法について紹介します。
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【de novoデザイン】ProteinSolverでデザインしたタンパク質をAlphaFold2で構造予測

ProteinSolverを用いてデザインしたタンパク質の評価指標の1つとして、AlphaFold2による予測構造を利用したデザイン事例を紹介します。
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【MDシミュレーション】創薬研究におけるMDシミュレーションの適応事例

タンパク質の分子動力学シミュレーションに関するレビュー論文を紹介します。
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【量子コンピュータ】Rosettaの機能を量子コンピュータで実現 QPackerとは

量子アルゴリズムでRosetta Packerの手法を実現させた、QPackerについて紹介します。
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【de novoデザイン】タンパク質の2次構造をパラメータで表現する

"protein universe"と呼ばれるタンパク質構造の空間の中で、未開拓な構造や機能を探索する方法についてレビューした論文を紹介します。
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【タンパク質デザイン】ProteinSolverの使い方

ProteinSolverをウェブサーバで使用する際のプロトコルを紹介します。
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【de novoデザイン】GNNを利用したタンパク質デザインモデルProteinSolverを解説

グラフニューラルネットワークを利用したタンパク質デザインモデル、ProteinSolverを紹介します。
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【量子コンピュータ】GNNモデルを用いたタンパク質デザインを量子コンピュータで実現?

タンパク質の構造予測問題に対して、量子コンピュータによる解決に適した手法について、紹介します。