Articles 【リッド設計】静的なde novoバインダーをリガンド誘導型スイッチに変える汎用戦略
静的なde novoバインダーEPICに新しいヘリックス「蓋」を後付けするだけで、サブナノモル親和性・100倍超の特異性・数ヶ月の残留時間を実現し、FRETバイオセンサーにまで発展させた——リガンド依存的な構造変化分子の汎用設計戦略を紹介します！
2026-09
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Articles 【TriFlow】離散フローマッチング×3トラックアーキテクチャでProteinMPNNを超える配列設計モデル
ProteinMPNNの後継となるか。離散フローマッチングと3トラックアーキテクチャを組み合わせた新配列設計モデルTriFlowが、500標的規模のバインダー設計ベンチマークでBindCraft/RFdiffusionパイプラインの成功率を底上げています！
Articles 【Vilya-2】非天然ペプチド医薬の構造予測でco-folding勢を圧倒する全原子拡散トランスフォーマー
全原子拡散トランスフォーマーVilya-2が、非天然アミノ酸・マクロサイクルを含むペプチド医薬の構造予測（Riptidesベンチマーク）でBoltz-2を大差で上回るSOTA精度を達成しています！
Articles 【ABOPD】拡散モデルに”自分の癖”を教え込む、抗体CDR-H3デザインの後処理学習
抗体のCDR（相補性決定領域）、特に最も柔軟で難しいCDR-H3をデザインする拡散モデルに対して、生成済みモデルをさらに鍛える「後処理学習」の手法ABOPDを紹介します！
Articles SimBinder-IF：構造情報とPreference Learningを組み合わせて抗体の結合親和性を効率よく最適化する手法
構造情報を利用するESM-IFにPreference Learning（SimPO）を組み合わせ、少ないパラメータ更新で抗体の結合親和性向上を目指したSimBinder-IFを紹介します！
Articles Vilya-1とは？多様なマクロサイクルを原子レベルで扱う構造予測・設計モデル
マクロサイクルの立体構造を生成し、膜透過性などの物性予測や新規分子設計にも利用できる深層学習モデル「Vilya-1」を紹介します！
Articles OpenDDE：オープンソースで最先端の共折りたたみを目指す創薬AI基盤モデル
生体分子複合体の構造予測を中核としたオープンソースAI基盤モデル「OpenDDE」を紹介します！
Articles 抗原ごとに賢く順位づける：In-Context Learningによる抗体親和性ランキング「AbICL」
抗原ごとの既知の親和性比較を「文脈」として活用することで、追加学習なしに抗体親和性ランキングを改善する新しいIn-Context Learningフレームワーク「AbICL」を紹介します！
Articles IgGM2：抗体・ナノボディ・TCRを統合的に設計するオールアトム基盤モデル
抗体・ナノボディ・TCRの構造予測とCDR設計を一つのオールアトム生成モデルで統合し、配列と構造を同時に設計する新しい免疫受容体設計フレームワーク IgGM2を紹介します！
Articles Protein Language Modelを活用した多タスク学習で、6つのタンパク質開発性プロパティをまとめて予測する「Prot2Prop」
構造情報を取り込んだProtein Language Model「ProstT5」を活用し、6種類のタンパク質開発性プロパティを1つのモデルで同時に予測する多タスク学習モデル「Prot2Prop」を紹介します！