Articles 【コミュニティ】第１回タンパク質デザインコンペの結果報告！
タンパク質デザインコンペのレポートを紹介します！
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Articles 【タンパク質言語モデル】中規模の自然言語モデルをタンパク質設計用途にチューニング
汎用的に利用される自然言語モデルを、タンパク質モデリング目的にチューニングしたモデルを紹介します！
Articles 【抗体デザイン】アラニンリピートモチーフの出現を抑制する抗体設計手法 ASSD フレームワークを紹介
繰り返し配列の出現を抑制した非自己回帰モデルベースの抗体デザイン手法 ASSD framework を紹介します！
Articles 【バインダーデザイン】構造柔軟性の高いモチーフにも結合できるペプチドバインダーをデザインするには
標的エピトープモチーフに結合するペプチドバインダーを設計する手法 moPPIt を紹介します！
Articles 【配列デザイン】米国スタートアップ Plofluent Bio がタンパク質言語モデルを用いた配列設計手法 prose LM を公開
タンパク質言語モデルを活用した、タンパク質配列設計手法 proseLM を紹介します！
Articles 【結合ポケット予測】GCN を利用したリガンド結合サイト予測手法を紹介！
グラフトランスフォーマーニューラルネットワークを活用した、リガンド結合サイトの予測手法を紹介します！
Articles 【タンパク質デザイン】自然言語からタンパク質をデザインする方法
自然言語で記述した情報から、その内容を反映したタンパク質配列を生成する手法 Pinal を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】ドメイン生成アルゴリズムを活用した抗体活性予測手法を紹介します
ドメイン生成アルゴリズムを利用した、抗体の結合活性予測手法を紹介します！
Articles 【ProteinMPNN】免疫原性の低い配列を設計できる inverse folding モデル、CAPE-MPNN とは
Inverse folding タスクで、MHC-class I 提示可能性の低い配列を設計できるチューニングモデル CAPE-MPNN を紹介します！
Articles 【PLM】タンパク質の変異体予測に、”few-shot fitness prediction” を活用するときのコツ
ランキングベースの損失関数でファインチューニングすることで、タンパク質言語モデルによる変異体予測成績を改善できることを紹介します！