Articles Equivariant Neural Networksで抗体デザインに挑戦
抗原・抗体複合体のドッキング予測とデザインのため、Hierarchical Equivariant Refinement Network (HERN)を提案した論文を紹介します。
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Articles Articles 【抗体デザイン】深層学習を利用した抗体のヒト化モデルBioPhiとは
抗体のヒト化スコアの算出と、ヒト化デザインを計算機で行うためのプラットフォームBioPhiを紹介しています。
Articles 【抗体デザイン】”Active Learning”を使って抗体設計に挑戦
抗体工学の予測・生成モデルに"active learning"を利用した実施例です。
Articles 【抗体デザイン】拡散モデルを使って、抗原結合抗体をデノボデザイン
拡散モデルを用いた抗体のデザイン手法を提案している論文です。
Articles 【抗体デザイン】抗体の構造・配列生成を反復的に精緻化する手法、RefineGNNについて
抗体の構造・配列生成を反復的に精緻化する手法、RefineGNNを紹介します。
Articles 【抗体デザイン】「抗体」と「自然言語」の共通点と相違点
言語学的特性をもとに、抗体に存在する規則を発見するために重要な要素を解説した論文を紹介します。
Articles 【抗体デザイン】免疫ライブラリを使って、結合抗体を分類・生成する深層学習モデル
抗体のスクリーニングデータを使って、抗原結合抗体を分類・生成するモデルを紹介します。
Articles 【タンパク質構造解析】タンパク質構造を「周期表」で表現
タンパク質の構造レパトアを、周期表としてまとめる方法について紹介します。
Articles 【抗体デザイン】Q学習を利用したH3の抗体最適化手法を紹介
Q学習による深層強化学習を利用して、抗体のデザインを試みた論文を紹介します。
Articles 【de novoデザイン】ProteinSolverでデザインしたタンパク質をAlphaFold2で構造予測
ProteinSolverを用いてデザインしたタンパク質の評価指標の1つとして、AlphaFold2による予測構造を利用したデザイン事例を紹介します。