Articles 【抗体デザイン】計算科学による抗体構造モデリング・デザイン手法まとめ
抗体工学を対象とした計算科学的手法のレビューを紹介します。
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Articles Articles 【AbDesign】de novo設計・評価の逐次サイクルにより、高親和性抗体を創成
in silicoで標的抗原に結合する抗体をデザインするシステム AbDesignを、2種の標的抗原に対して適応した事例を紹介します。
Articles 【AbDesign】抗体のinsilicoデザイン手法の原理を解説
標的抗原に結合する抗体をデザインするアルゴリズム、AbDesignを紹介します。
Articles 【抗体デザイン】深層学習を活用したH3ループデザイン手法の原理
深層学習を活用して、抗体H3ループの構造をモデリングする技術であるDeepH3を紹介します。
Articles 【タンパク質構造解析】遺伝子組み換えとドメイン構造との関係を示す、『スキーマ』とは
タンパク質の3次構造として再構築可能な1種のフラグメントとして、スキーマ(SCHEMA)の概念を提案した論文を紹介します。
Articles 【タンパク質構造解析】表面露出残基をウェブサーバで解析 DeepRExとは
タンパク質の表面露出領域を予測する深層学習手法DeepRExについて紹介します。
Articles 【タンパク質構造解析】深層学習を利用した、タンパク質の表面露出領域予測
深層学習を利用した、溶媒接触可能領域の推定法 EAGERERについて紹介します。
Articles 【抗体モデリング】H3ループの予測手法
標的抗原に結合する抗体の、HCDR3をデザインする手法について紹介します。
Articles 【Descriptor】3Dゼルニケ記述子を利用してタンパク質表面の特徴量を記述
抗体の抗原結合表面の形状と電荷プロファイルを、3Dゼルニケ記述子で表現することで、抗原結合性を予測することに成功した論文を紹介します。
Articles 【CASPでハイスコア】DLタンパク質構造予測手法のまとめ
深層学習を利用した各タンパク質構造予測手法の特徴を紹介します。