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抗体と抗原の結合相手を配列から予測する:Contrastive Learning を使った CALM モデル

抗体配列と抗原配列の一次構造のみから、どの抗体がどの抗原に結合するかを予測するための機械学習モデル「CALM」を紹介します!
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リガンド結合親和性予測のためのアクティブラーニングプロトコルのベンチマーク

アクティブラーニングを利用した低分子リガンドと標的タンパク質の結合親和性予測手法について、その精度をベンチマークした論文を紹介します!
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【AF2】ドメイン-モチーフインターフェースは、AF2-multimer で予測できる?

AF2 を用いた結合界面構造の予測の妥当性や限界について紹介します!
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【相互作用予測】リガンド結合予測に、タンパク質の構造情報は必要?

深層学習を用いた、タンパク質・低分子リガンド間の相互作用強度予測モデルが、どのような特徴量を捉えて予測しているのか、検証した論文を紹介します!