Articles AI設計バインダーはCAR-T細胞のセンサーとなるか
AI設計のミニバインダーをCAR-T細胞の抗原認識ドメインとして評価した研究です！
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Articles 追加学習なしでバインダー設計を磨き直す「RFOptimization」
RFOptimization (RFO) は、RFdiffusion等が生成した「惜しくも基準未達」なバインダー設計を、学習不要（training-free）でその場から磨き上げるフレームワークです！
Articles LNPより1万倍効率 ― RFdiffusion設計タンパク質で作る人工RNAカプセル
RFdiffusionでデザインした「自然界に存在しない対称性」のタンパク質集合体を土台に、RNA輸送カプセル「STV-C8」を構築したレポートです。
Articles 人間の判断ゼロで結合率27% ― Claudeがコンペ優勝作を上回った完全自律バインダー設計
Anthropicは、人間がエピトープも設計判断もいっさい行わない「完全自律」のタンパク質バインダー設計キャンペーンをClaudeに16標的分実施させました。354/1,320設計（27%）が実際に結合、E3リガーゼRBX1では公開デザインコンペの優勝作を同一プレートで上回る親和性を達成しています。
Articles LLMは”良い候補”を測れない ― ベイズ最適化と融合した「Large Discovery Model」が拓く科学的発見の自動化
LLMは"良い候補"を測れない、ベイズ最適化は"候補"を作れない――この相補的な弱点を1つのループに統合した「Large Discovery Model」は、AI研究コード探索・抗体設計・創薬という3つの異なる科学的発見タスクで、LLM単独やベイズ最適化単独を上回る成果を報告しています！
Articles 511種のAI抗体設計を実験で検証：ブラインドベンチマーク「AIntibody」
CASP流のブラインド・プロスペクティブベンチマーク「AIntibody」が、29組織511種のAI設計抗体を実験的に検証——AI創薬の「効く場面・効かない場面」を浮き彫りにした結果に。
Articles 【Diff-Switch】拡散モデル×メタダイナミクスで手作業なしのタンパク質スイッチ設計へ
閉じた状態の構造を1つ渡すだけで、開いた状態のバックボーンを拡散モデルが自動で探し出す——Diff-Switchは、これまで手作業に頼っていたタンパク質スイッチのバックボーンアンサンブル構築を自動化します！
Articles 【リッド設計】静的なde novoバインダーをリガンド誘導型スイッチに変える汎用戦略
静的なde novoバインダーEPICに新しいヘリックス「蓋」を後付けするだけで、サブナノモル親和性・100倍超の特異性・数ヶ月の残留時間を実現し、FRETバイオセンサーにまで発展させた——リガンド依存的な構造変化分子の汎用設計戦略を紹介します！
Articles 【TriFlow】離散フローマッチング×3トラックアーキテクチャでProteinMPNNを超える配列設計モデル
ProteinMPNNの後継となるか。離散フローマッチングと3トラックアーキテクチャを組み合わせた新配列設計モデルTriFlowが、500標的規模のバインダー設計ベンチマークでBindCraft/RFdiffusionパイプラインの成功率を底上げています！
Articles 【Vilya-2】非天然ペプチド医薬の構造予測でco-folding勢を圧倒する全原子拡散トランスフォーマー
全原子拡散トランスフォーマーVilya-2が、非天然アミノ酸・マクロサイクルを含むペプチド医薬の構造予測（Riptidesベンチマーク）でBoltz-2を大差で上回るSOTA精度を達成しています！