protein design

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LLMエージェントのタンパク質設計における苦手分野とは

LLMエージェントはタンパク質設計ツールを適切に選択できる一方、生成した候補を十分に比較・評価せず設計を終了する傾向があり、その「評価の浅さ」が性能向上の大きな課題であることをBioDesignBenchが明らかにしています。
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【タンパク質デザイン】全原子生成モデル BlotzGen でバインダーを設計

あらゆる種類の生体分子(タンパク質、ペプチド、ナノボディ、小分子、RNAなど)を標的とする汎用バインダー設計モデルである BoltzGen を紹介します!
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【タンパク質デザイン】リン酸化に応答して細胞骨格フィラメントを形成するデノボタンパク質をデザイン!

デノボ設計によって制御可能な多成分性タンパク質フィラメント(繊維状構造体)を創製する新技術を紹介します!
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【抗体デザイン】RFDiffusionを利用した抗体デザイン事例がついに現る

ファインチューニングされたRFDiffusionで、抗原結合VHHをデザインした事例を紹介します!
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【タンパク質デザイン】サイトカイン受容体の機能阻害が可能な膜貫通ドメインをデノボデザイン

エリスロポエチン受容体の膜貫通ドメインに結合するタンパク質を、デノボデザインした実施例を紹介します!
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【タンパク質デザイン】リガンド結合ポケットをデザインできる PocketGen について解説します

リガンドに結合するタンパク質ポケットをデザインする手法 PocketGen について紹介します!
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【配列デザイン】Webブラウザで実行できる新規配列デザイン手法を紹介!

非自己回帰モデルを活用した新規配列デザイン手法を開発し、DIProT という Web アプリを実装した成果を紹介します!