ProteinMPNN

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【Diff-Switch】拡散モデル×メタダイナミクスで手作業なしのタンパク質スイッチ設計へ

閉じた状態の構造を1つ渡すだけで、開いた状態のバックボーンを拡散モデルが自動で探し出す——Diff-Switchは、これまで手作業に頼っていたタンパク質スイッチのバックボーンアンサンブル構築を自動化します!
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【ProteinMPNN】免疫原性の低い配列を設計できる inverse folding モデル、CAPE-MPNN とは

Inverse folding タスクで、MHC-class I 提示可能性の低い配列を設計できるチューニングモデル CAPE-MPNN を紹介します!
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【抗体デザイン】ProteinMPNNとAbLangのアンサンブルモデルで抗体配列をデザイン

逆折り畳みモデルと抗体の言語モデルとのアンサンブルで、抗体の配列設計精度を向上させた論文を紹介します!
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【ProteinMPNN】配列再設計でタンパク質の発現量を改善するコツ

ProteinMPNN を利用した配列再設計で、天然タンパク質の機能や熱安定性、発現量を改善した実施例を紹介します!
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【AlphaFold】バインダーデザインの精度を向上させるAF2とProteinMPNNの役割

AF2やProteinMPNNを使うことで、バインダーのデザイン精度を向上させることができることを実証しています。