RFdiffusion

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追加学習なしでバインダー設計を磨き直す「RFOptimization」

RFOptimization (RFO) は、RFdiffusion等が生成した「惜しくも基準未達」なバインダー設計を、学習不要(training-free)でその場から磨き上げるフレームワークです!
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LNPより1万倍効率 ― RFdiffusion設計タンパク質で作る人工RNAカプセル

RFdiffusionでデザインした「自然界に存在しない対称性」のタンパク質集合体を土台に、RNA輸送カプセル「STV-C8」を構築したレポートです。
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人間の判断ゼロで結合率27% ― Claudeがコンペ優勝作を上回った完全自律バインダー設計

Anthropicは、人間がエピトープも設計判断もいっさい行わない「完全自律」のタンパク質バインダー設計キャンペーンをClaudeに16標的分実施させました。354/1,320設計(27%)が実際に結合、E3リガーゼRBX1では公開デザインコンペの優勝作を同一プレートで上回る親和性を達成しています。
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RFdiffusion3とAlphaFold3によるDNAバインダー設計

RFdiffusion3とAlphaFold3を組み合わせ、任意DNA配列を狙って識別するde novoタンパク質設計の成功率を大幅に高めた、DNAバインダー設計の新しい方向性を示す研究を紹介します!
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【タンパク質デザイン】リン酸化ペプチドバインダーを設計できる RFDの拡張版 RFD2-MI とは

RFDiffusion2を拡張してリン酸化依存的タンパク質結合分子を設計可能にした研究を紹介します!
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【RFdiffusion】全原子生成モデル RFdiffusion3 の威力を紹介!

これまでのRFdiffusion系列を発展させた全原子レベルのタンパク質設計モデル RFD3 を紹介します!
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【酵素デザイン】酵素の設計を可能にするRFdiffusion の新バージョン RFdiffusion2 を紹介

原子レベルの生成を可能にする酵素設計に適したモデル RFdiffusion2 を紹介します!
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【RFpeptide】RFDiffusion を利用した環状ペプチドデザインで single nM のバインダー取得に成功

RFDiffusion を用いた環状ペプチド設計で、実験的にバインダーを設計できることを証明した論文を紹介します!
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【ペプチドデザイン】環状ペプチドを RFDiffusion で設計する方法

RFDiffusion を利用した環状ペプチド設計手法を紹介します!
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【抗原デザイン】GPCRの熱安定化+分子量増大のためのデノボスキャフォールドデザイン

対象の GPCR をクライオ電子顕微鏡で構造解析するための、熱安定化かつ分子量増大を目的としたタンパク質エンジニアリング手法を紹介します!