Articles 【AbDesign】de novo設計・評価の逐次サイクルにより、高親和性抗体を創成
in silicoで標的抗原に結合する抗体をデザインするシステム AbDesignを、2種の標的抗原に対して適応した事例を紹介します。
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Articles Articles 【AbDesign】抗体のinsilicoデザイン手法の原理を解説
標的抗原に結合する抗体をデザインするアルゴリズム、AbDesignを紹介します。
3D model 【今週の構造】それ以外のことは、全部二の次
3Dプリンターでタンパク質構造モデルを作成します。
Articles 【抗体デザイン】深層学習を活用したH3ループデザイン手法の原理
深層学習を活用して、抗体H3ループの構造をモデリングする技術であるDeepH3を紹介します。
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タンパク質の3次構造として再構築可能な1種のフラグメントとして、スキーマ(SCHEMA)の概念を提案した論文を紹介します。
Articles 【タンパク質構造解析】表面露出残基をウェブサーバで解析 DeepRExとは
タンパク質の表面露出領域を予測する深層学習手法DeepRExについて紹介します。
3D model 【今週の構造】億万長者ビルゲイツの将来を見る目
有名人の名言から、タンパク質の構造をデザインします。今週はビルゲイツの名言です。
Articles 【タンパク質構造解析】深層学習を利用した、タンパク質の表面露出領域予測
深層学習を利用した、溶媒接触可能領域の推定法 EAGERERについて紹介します。
Articles 【抗体モデリング】H3ループの予測手法
標的抗原に結合する抗体の、HCDR3をデザインする手法について紹介します。
Articles 【Descriptor】3Dゼルニケ記述子を利用してタンパク質表面の特徴量を記述
抗体の抗原結合表面の形状と電荷プロファイルを、3Dゼルニケ記述子で表現することで、抗原結合性を予測することに成功した論文を紹介します。