【今週の構造】あきらめたら・・・

格言

Don’t give up…

Cleave to hope till the very end.

When you give up, that’s when the game is over.

SLAM DUNK

アミノ酸配列

DQNTGIVEVPCLEAVETQHQPETILLTHEVERYENDWHENYQVGIVEVPTHATSWHENTHEGAMEISQVER

変換ルール

• 以下のアルファベットは、アミノ酸1文字表記が存在しないため、下記のとおり変換
• 記号は削除

• B　→　D
• J　→　I
• O　→　Q
• U　→　V
• X　→　Y
• Z　→　N

構造予測

ColabFold: AlphaFold2 using MMseqs2

settings

• msa_mode: MMseqs(Uniref+Environmental)
• model_type:auto
• pair_mode: unpaired+paired
• num_recycles:3

構造モデル

出力モデル

出力結果