Articles Masked Language Modelをどう使いこなすか？抗体設計におけるサンプリング戦略の重要性
抗体設計において「モデルよりサンプリングが重要」という視点を提示した、実践的かつ示唆に富む研究を紹介します！
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Articles 抗体と抗原の結合相手を配列から予測する：Contrastive Learning を使った CALM モデル
抗体配列と抗原配列の一次構造のみから、どの抗体がどの抗原に結合するかを予測するための機械学習モデル「CALM」を紹介します！
Articles 抗体–抗原構造予測の信頼性を検証した大規模ベンチマーク
ナノボディ–抗原複合体の大規模ベンチマークを構築し、AlphaFold3などの最新モデルの信頼度スコアが実際の結合特異性と相関するかを検証した論文を解説します！
Articles 抗体–抗原インターフェースに着目したADC活性予測モデル「ABFormer」の実力
抗体–抗原結合インターフェースを文脈的に埋め込み表現へと変換する Transformer ベースのモデル「ABFormer」を提案し、抗体薬物複合体（ADC）の活性予測精度を向上させています！
Articles AlphaFold3を組み込んだ高スループット抗体探索パイプライン
酵母ディスプレイとAlphaFold3を統合することで、複数標的に結合するVHH抗体を効率よく見つけ出す新しい抗体探索パイプラインを解説します！
Articles 全原子レベルでとらえる抗体言語モデルで抗体を最適化する
全原子相互作用モデリングと抗体言語モデルを組み合わせ、抗体予測から最適化までを一貫して行う InterAb / InterAb-Opt を解説しました。
Articles 生成AI「Origin-1」による de novo 抗体設計の実証研究
ゼロ情報エピトープに対する抗体設計という難題に、生成AIでどこまで迫れるのかを実験的に示した研究を、初学者向けに解説します！
Articles 400万抗体で検証! FLAb2ベンチマークの結果について
抗体AIはどこまで「開発しやすさ」を見抜けるのか――400万抗体を用いたFLAb2ベンチマークが、その現実的な限界を明らかにした論文です。
Articles 【抗体デザイン】contrastive learning を活用した反復抗体設計手法 HyperBind2 を紹介
「失敗から賢くなる抗体探索プロセス」を実現する抗体設計モデル HyperBind2 を紹介します！
Articles 【抗体デザイン】抗体最適化のための強化学習最新手法を紹介！
可変長CDRインフィリングが可能な抗体LLM（IgLM）に、オンラインRL（PPO+KL）とオフラインRL（DRO）を統合し、「構造指標」と「実験データ」の両方で機能最適化できる枠組みを紹介します！