antibody

Articles

GeoFlow-V3とは?最大50配列・3週間で抗体候補を見つける、迅速de novo抗体設計パイプラインの全体像

抗体-抗原複合体の構造予測とde novo抗体設計を統合した原子レベル拡散モデル「GeoFlow-V3」を紹介します!
Articles

SEPIA:合成エピトープと大規模実験データで広げる、抗体デノボ設計のための構造学習基盤

合成エピトープ設計とAlphaSeq実験を組み合わせて2,600万件超の結合データを作り、抗体デノボ設計に不足していた大規模な正例・負例構造学習基盤を構築した研究を紹介します!
Articles

AIが創薬を自動化する時代へ:自律型抗体設計エージェント「Latent-Y」を解説

テキスト指示だけで抗体やペプチドの設計から検証までを自律的に実行し、実験的に有効な分子を創出できるAIエージェント「Latent-Y」を紹介します!
Articles

IgPose:生成データ拡張で抗体–抗原結合予測を強化する新しい計算フレームワーク

生成データ拡張と幾何学GNNを組み合わせ、抗体–抗原結合予測の精度と汎化性能を高めたIgPoseを解説します!
Articles

Masked Language Modelをどう使いこなすか?抗体設計におけるサンプリング戦略の重要性

抗体設計において「モデルよりサンプリングが重要」という視点を提示した、実践的かつ示唆に富む研究を紹介します!
Articles

抗体と抗原の結合相手を配列から予測する:Contrastive Learning を使った CALM モデル

抗体配列と抗原配列の一次構造のみから、どの抗体がどの抗原に結合するかを予測するための機械学習モデル「CALM」を紹介します!
Articles

抗体–抗原構造予測の信頼性を検証した大規模ベンチマーク

ナノボディ–抗原複合体の大規模ベンチマークを構築し、AlphaFold3などの最新モデルの信頼度スコアが実際の結合特異性と相関するかを検証した論文を解説します!
Articles

抗体–抗原インターフェースに着目したADC活性予測モデル「ABFormer」の実力

抗体–抗原結合インターフェースを文脈的に埋め込み表現へと変換する Transformer ベースのモデル「ABFormer」を提案し、抗体薬物複合体(ADC)の活性予測精度を向上させています!
Articles

AlphaFold3を組み込んだ高スループット抗体探索パイプライン

酵母ディスプレイとAlphaFold3を統合することで、複数標的に結合するVHH抗体を効率よく見つけ出す新しい抗体探索パイプラインを解説します!
Articles

全原子レベルでとらえる抗体言語モデルで抗体を最適化する

全原子相互作用モデリングと抗体言語モデルを組み合わせ、抗体予測から最適化までを一貫して行う InterAb / InterAb-Opt を解説しました。