Articles Genie 3とは何か？SE(3)等変性を“捨てずに進化”させた高速・高性能な次世代タンパク質デザインモデル
SE(3)等変性を維持したall-atom拡散モデルによって、タンパク質binder設計・motif scaffolding・新規構造生成を高速かつ高性能に進化させた次世代プロテインデザイン手法 Genie 3を紹介します！
Warning: Undefined variable $author in /home/c0220561/public_html/biospace.info/wp-content/themes/cocoon/functions.php on line 131
biospace
Articles 
Articles BioKinemaとは何か？ 全原子レベルで「分子の動き」を生成する、物理法則ベースの生体分子ダイナクス基盤
物理法則に基づく時間attentionと階層的拡散生成によって、全原子レベルの生体分子ダイナクスを高速に再現しようとする、新しいMD代替候補モデル BioKinema を紹介します！
Articles 1本のタンパク質に合わせてAIをその場で調整する――ProteinTTTが切り開く「個別最適化」型タンパク質AI
タンパク質言語モデルを「1本のタンパク質」に対して推論時に自己教師あり適応させることで、構造予測や変異効果予測の精度を改善する新しい個別最適化アプローチ、ProteinTTTについて解説します！
Articles 環状置換に不変な表現を学習して、潜在的なタンパク質ホモログを発見する
タンパク質の環状置換による末端位置の違いを超えて構造類似性を捉えることで、これまで見逃されやすかった進化的・構造的関係を大規模に発見できる検索モデル「CIRPIN」について紹介します！
Articles AF3-TurboAbとは？ 抗体レパトアを“構造ごと”高速解読し、抗体設計を大規模化する新しい基盤技術
AlphaFold3を抗体レパトア全体へ拡張し、大規模かつ高速な構造予測を通じてエピトープ地図作成や実用的な抗体設計を加速する基盤技術 AF3-TruboAb について紹介します！
Uncategorized RFdiffusion3とAlphaFold3によるDNAバインダー設計
RFdiffusion3とAlphaFold3を組み合わせ、任意DNA配列を狙って識別するde novoタンパク質設計の成功率を大幅に高めた、DNAバインダー設計の新しい方向性を示す研究を紹介します！
Articles GeoFlow-V3とは？最大50配列・3週間で抗体候補を見つける、迅速de novo抗体設計パイプラインの全体像
抗体-抗原複合体の構造予測とde novo抗体設計を統合した原子レベル拡散モデル「GeoFlow-V3」を紹介します！
Articles evedesignとは？タンパク質設計AIを“つなぐ”統合基盤が目指す、誰でも使えるバイオシーケンス設計
進化モデル・言語モデル・構造モデルを共通仕様で組み合わせ、タンパク質・抗体・酵素設計をより再現性高く、柔軟に、そして非専門家にも使いやすくすることを目指した統合型バイオシーケンス設計基盤 evedesign を紹介します！
Articles 物理ベース設計と深層学習を組み合わせたCLAIREが切り拓くデノボ小分子バインダー設計
小分子結合タンパク質設計において、水素結合の精密配置を起点に物理ベース設計と深層学習を統合したCLAIREは、従来より高い実験成功率でデノボバインダー創出を実証した研究です！
Articles SEPIA：合成エピトープと大規模実験データで広げる、抗体デノボ設計のための構造学習基盤
合成エピトープ設計とAlphaSeq実験を組み合わせて2,600万件超の結合データを作り、抗体デノボ設計に不足していた大規模な正例・負例構造学習基盤を構築した研究を紹介します！